RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 TMCO5BA8MYB1 307 aa29.28■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP29.28■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 CSH1P0DML2 217 aa29.28■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 CSH2P0DML3 217 aa29.28■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 RAB41Q5JT25 222 aa29.28■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa29.28■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 ITIH5Q86UX2 942 aa29.28■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 CPXM1Q96SM3 734 aa29.28■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 SPTLC3Q9NUV7 552 aa29.28■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 TNFRSF10BO14763 440 aa29.27■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 NDUFA10O95299 355 aa29.27■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 CCZ1BP86790 482 aa29.27■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 PTPN20Q4JDL3 420 aa29.27■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM110Q86TL2 294 aa29.27■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 GIPC2Q8TF65 315 aa29.27■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 ISCUQ9H1K1 167 aa29.27■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 COMMD8Q9NX08 183 aa29.27■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 TAS2R14Q9NYV8 317 aa29.27■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 MMP8P22894 467 aa29.26■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 SPA17Q15506 151 aa29.26■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 TAF12Q16514 161 aa29.26■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 RAD9BQ6WBX8 426 aa29.26■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa29.26■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa29.26■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 VN1R2Q8NFZ6 395 aa29.26■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 GPR152Q8TDT2 470 aa29.26■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO44Q9H4M3 255 aa29.26■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 NENFQ9UMX5 172 aa29.26■■■□□ 2.28
GIPC1-201ENST00000345425 SLC38A8A6NNN8 435 aa29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 E5RJQ4 531 aa29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 LCA5LO95447 670 aa29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 FTLP02792 175 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 TKTL1P51854 596 aa29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 ADIGQ0VDE8 80 aa29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 MYLIPQ8WY64 445 aa29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 PSMG2Q969U7 264 aa29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 C18orf8Q96DM3 657 aa29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 SFXN1Q9H9B4 322 aa29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 ADAM22Q9P0K1 906 aa29.26■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 CALB1P05937 261 aa29.25■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 LCP1P13796 627 aa29.25■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 GABRB2P47870 512 aa29.25■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 RBM10P98175 930 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 MTF1Q14872 753 aa29.25■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 C10orf76Q5T2E6 689 aa29.25■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 MICALL1Q8N3F8 863 aa29.25■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 VCPIP1Q96JH7 1222 aa29.25■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 STRIP2Q9ULQ0 834 aa29.25■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 XYLBO75191 536 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 RFPL2O75678 378 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO21O94952 628 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 GLP2RO95838 553 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 ADAM15Q13444 863 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 MON1BQ7L1V2 547 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM11Q96F44 468 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 C11orf70Q9BRQ4 267 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 CNGB3Q9NQW8 809 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 GREB1Q4ZG55 1949 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 FAM170AA1A519 330 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 POU2F2P09086 479 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 MCOLN2Q8IZK6 566 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 SCAMP5Q8TAC9 235 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 IL37Q9NZH6 218 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 USP3Q9Y6I4 520 aa29.24■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 PIK3R2O00459 728 aa29.23■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 CCL16O15467 120 aa29.23■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 ERBB2P04626 1255 aa29.23■■■□□ 2.27
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GIPC1-201ENST00000345425 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
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GIPC1-201ENST00000345425 GUCD1Q96NT3 240 aa29.23■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 TTLL2Q9BWV7 592 aa29.23■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 PRKD2Q9BZL6 878 aa29.23■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 LINC01565O15544 149 aa29.22■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 GABBR2O75899 941 aa29.22■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 FOSL2P15408 326 aa29.22■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 MTMR3Q13615 1198 aa29.22■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 ULBP1Q9BZM6 244 aa29.22■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 MTMR10Q9NXD2 777 aa29.22■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 WDR35Q9P2L0 1181 aa29.22■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
GIPC1-201ENST00000345425 TJP2Q9UDY2 1190 aa29.22■■■□□ 2.27
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