RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 IRX4P78413 519 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 JAG1P78504 1218 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 BASP1P80723 227 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TEX44Q53QW1 395 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SATL1Q86VE3 508 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 PYDC1Q8WXC3 89 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM49D1C9J1S8 452 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 IMPDH2P12268 514 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TNNI1P19237 187 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CHN2P52757 468 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 PDE1BQ01064 536 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SPP2Q13103 211 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 UGCGQ16739 394 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MMEL1Q495T6 779 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 IGDCC3Q8IVU1 814 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 APBB2Q92870 758 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MPP4Q96JB8 637 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 GMEB1Q9Y692 573 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 AP1G1O43747 822 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF862O60290 1169 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 KRT37O76014 449 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 KITP10721 976 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CCNFP41002 786 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 AQP4P55087 323 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 OGDHQ02218 1023 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 PSMD6Q15008 389 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 PDK3Q15120 406 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 DOK7Q18PE1 504 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC36Q1X8D7 754 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 LZICQ8WZA0 190 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MEI4A8MW99 385 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CST8O60676 142 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 WEE2P0C1S8 567 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 WASHC5Q12768 1159 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 LPCAT4Q643R3 524 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 BBS12Q6ZW61 710 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM74Q86UV6 250 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM73Q86UV7 250 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 NUDCD3Q8IVD9 361 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MIPOL1Q8TD10 442 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MKS1Q9NXB0 559 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CIDEBQ9UHD4 219 aa21.09■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ITGA2BP08514 1039 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 USP46P62068 366 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM259Q4ZIN3 620 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 LGSNQ5TDP6 509 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC26A7Q8TE54 656 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SIKE1Q9BRV8 207 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TEX264Q9Y6I9 313 aa21.08■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 EXTL3O43909 919 aa21.08■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 SERPINB2P05120 415 aa21.08■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM200BP0CF97 657 aa21.08■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 TKFCQ3LXA3 575 aa21.08■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.08■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 BTBD9Q96Q07 612 aa21.08■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.08■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa21.08■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 SDR42E2A6NKP2 422 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 SNNO75324 88 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 DLG1Q12959 904 aa21.07■□□□□ 0.96
PPP1CC-201ENST00000335007 USP4Q13107 963 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms