RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323076.6

LCP1-201, Transcript of lymphocyte cytosolic protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LCP1, Length 3,787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1-201ENST00000323076 MCM9Q9NXL9 1143 aa7.3□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.3□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa7.3□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 PLXNB2O15031 1838 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 OR5K3A6NET4 321 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.242e-8■■□□□ 13.3
LCP1-201ENST00000323076 NCAM2O15394 837 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 IL10P22301 178 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ERFP50548 548 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 CDC20Q12834 499 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 SEMA3AQ14563 771 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 DUPD1Q68J44 220 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 AKAP14Q86UN6 197 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 BORCS5Q969J3 196 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 SELENOSQ9BQE4 189 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 KCTD10Q9H3F6 313 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 EMC3Q9P0I2 261 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 BCAP29Q9UHQ4 241 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 VWA7Q9Y334 891 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 MYH10P35580 1976 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ILVBLA1L0T0 632 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 SULT1B1O43704 296 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 CCDC22O60826 627 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 MYO1DO94832 1006 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 SLC26A2P50443 739 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 CASP5P51878 434 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 CHN2P52757 468 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 DLG1Q12959 904 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 NFRKBQ6P4R8 1299 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ZNF677Q86XU0 584 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 CNGA4Q8IV77 575 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 TTLL6Q8N841 843 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 VPS33AQ96AX1 596 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 CCDC51Q96ER9 411 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 OPALINQ96PE5 141 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 TSG101Q99816 390 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 PGAP2Q9UHJ9 254 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ITM2AO43736 263 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 NPM3O75607 178 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 BMP10O95393 424 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 TCF3P15923 654 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 PKLRP30613 574 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 TRIM23P36406 574 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 HARS2P49590 506 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 PHC1P78364 1004 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 PNOCQ13519 176 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 FAM124AQ86V42 546 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 RAET1EQ8TD07 263 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ANKS1AQ92625 1134 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 COG8Q96MW5 612 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 PSMB7Q99436 277 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 PLIN2Q99541 437 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 SNTG2Q9NY99 539 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 PCDHGB4Q9UN71 923 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.29□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 WDR91A4D1P6 747 aa7.28□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 RSPH10B2B2RC85 870 aa7.28□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 H0YIN7 160 aa7.28□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 ATP5HO75947 161 aa7.28□□□□□ -1.24
LCP1-201ENST00000323076 CBX6O95503 412 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms