RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297163.3

SMAD5-AS1-201, SMAD5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5-AS1, Length 1,816 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.14□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MCM8Q9UJA3 840 aa8.14□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa8.14□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CLUHO75153 1309 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NOTCH4Q99466 2003 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A8MXQ7 604 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PPFIA2O75334 1257 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LRG1P02750 347 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ATF6P18850 670 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CD151P48509 253 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LMAN1P49257 510 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NDST1P52848 882 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NTHL1P78549 312 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 WHAMMQ8TF30 809 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PCED1BQ96HM7 432 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TWNKQ96RR1 684 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CYP3A43Q9HB55 503 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PIDD1Q9HB75 910 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ABCB6Q9NP58 842 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 USTQ9Y2C2 406 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CILPO75339 1184 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TUBB4AP04350 444 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RHOP08100 348 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CYP2F1P24903 491 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EPHA5P54756 1037 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NCAPHQ15003 741 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 WDR44Q5JSH3 913 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 UNC93AQ86WB7 457 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GJD3Q8N144 294 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PSMG2Q969U7 264 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MYLPFQ96A32 169 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LRRC3Q9BY71 257 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.13□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KCNJ18B7U540 433 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PTPN2P17706 415 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 BDNFP23560 247 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CCR2P41597 374 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MAGEA11P43364 429 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ALDH1A3P47895 512 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GPR15P49685 360 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EPHB3P54753 998 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ORC1Q13415 861 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CUL2Q13617 745 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KCNJ12Q14500 433 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TCP11X2Q5H9J9 407 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MIIPQ5JXC2 388 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PAQR9Q6ZVX9 377 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ACOT1Q86TX2 421 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TMC8Q8IU68 726 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FAM114A1Q8IWE2 563 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C12orf29Q8N999 325 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ITFG1Q8TB96 612 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TNIP3Q96KP6 325 aa8.12□□□□□ -1.11
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms