RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274711.6

LRRTM2-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM2, Length 6,017 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2-201ENST00000274711 GRIP2Q9C0E4 1043 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 ARMC7Q9H6L4 198 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PIDD1Q9HB75 910 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 KLHL28Q9NXS3 571 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 RNF112Q9ULX5 631 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PADI4Q9UM07 663 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PLCL2Q9UPR0 1127 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 C2CD2Q9Y426 696 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 ZFYVE9O95405 1425 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 A0A087X0T9 212 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 A0A1W2PQC6 194 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 DENND3A2RUS2 1198 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PSMD11O00231 422 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 HAT1O14929 419 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 RAD51CO43502 376 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 RGS10O43665 173 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 DYRK3O43781 588 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 TCEA3O75764 348 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 SUPT7LO94864 414 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 SEC24AO95486 1093 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 FGRP09769 529 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 VAV1P15498 845 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 RAG1P15918 1043 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 CDH3P22223 829 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PDHA2P29803 388 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 GSTT1P30711 240 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 AVPR1AP37288 418 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 GSSP48637 474 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 AP3M2P53677 418 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 AQP5P55064 265 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 RAB25P57735 213 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 ARPC4P59998 168 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 CAMK1Q14012 370 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PLCL1Q15111 1095 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 RASA2Q15283 850 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 TAF13Q15543 124 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PADI6Q6TGC4 694 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 REXO1L1PQ8IX06 675 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PJA1Q8NG27 643 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 CCDC126Q96EE4 140 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 C8orf37Q96NL8 207 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 ISCUQ9H1K1 167 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 DSN1Q9H410 356 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 NEUROD4Q9HD90 331 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 SH3GLB2Q9NR46 395 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 RRN3Q9NYV6 651 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 GPRC5DQ9NZD1 345 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 EFR3BQ9Y2G0 817 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 TELO2Q9Y4R8 837 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 MROH7Q68CQ1 1323 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 H3BN98 237 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 AXIN1O15169 862 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PLOD3O60568 738 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PGK1P00558 417 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 LDLRP01130 860 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 ALOX5P09917 674 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 TCF4P15884 667 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 IFNAR1P17181 557 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 S100A2P29034 98 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 GSTM5P46439 218 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PRELPP51888 382 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 CEBPGP53567 150 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 GMFBP60983 142 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 CENPCQ03188 943 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 SEL1L3Q68CR1 1132 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 TXNDC11Q6PKC3 985 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 DHFR2Q86XF0 187 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PALB2Q86YC2 1186 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 PPIL6Q8IXY8 311 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 OR7A2PQ8NGA2 310 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM2-201ENST00000274711 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms