RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 GOLPH3Q9H4A6 298 aa11.45□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 FNIP2Q9P278 1114 aa11.45□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 USP27XA6NNY8 438 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 MED7O43513 233 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 RRM1P23921 792 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 NSFP46459 744 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 TKTL1P51854 596 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 EMC1Q8N766 993 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 EDEM1Q92611 657 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 CLDND1Q9NY35 253 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 FBXW11Q9UKB1 542 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 DMDP11532 3685 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 TBX10O75333 385 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 PLD1Q13393 1074 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 RAB6CQ53S08 254 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 TTC39CQ8N584 583 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 ADAM32Q8TC27 787 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 ULBP1Q9BZM6 244 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 RAB6CQ9H0N0 254 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 OSGEPQ9NPF4 335 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 OSER1Q9NX31 292 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 DNAH14Q0VDD8 3507 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 NOTCH4Q99466 2003 aa11.44□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 YJEFN3A6XGL0 299 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 E7ENQ6 273 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 TNFRSF10BO14763 440 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 TBX18O95935 607 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 CCDC172P0C7W6 258 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 CCR2P41597 374 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 DUSP6Q16828 381 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 LIN9Q5TKA1 542 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 ERICH1Q86X53 443 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 CPNE8Q86YQ8 564 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 TMEM35BQ8NCS4 154 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 FAM149B1Q96BN6 582 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 IQCDQ96DY2 449 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 CORO1BQ9BR76 489 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 PAX3P23760 479 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 ALDH1A3P47895 512 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 GALCP54803 685 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 CENPCQ03188 943 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 OR6B2Q6IFH4 312 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 ING5Q8WYH8 240 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 TCEAL4Q96EI5 215 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 LRRC4Q9HBW1 653 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 CEP83Q9Y592 693 aa11.43□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 C2orf16Q68DN1 1984 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 GREB1Q4ZG55 1949 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 MDM4O15151 490 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 MMP8P22894 467 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 ANXA13P27216 316 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 PLA2G4AP47712 749 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 TAF10Q12962 218 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 PTP4A2Q12974 167 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 SLC5A9Q2M3M2 681 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 TRNP1Q6NT89 227 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 POTEHQ6S545 545 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 MON1BQ7L1V2 547 aa11.42□□□□□ -0.58
TTPA-201ENST00000260116 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms