RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 TNK2Q07912 1038 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 PPP3CAQ08209 521 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 KRT39Q6A163 491 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 TAS1R2Q8TE23 839 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 CYP2S1Q96SQ9 504 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 SDCBP2Q9H190 292 aa23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 ABL1P00519 1130 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 HDCP19113 662 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 ASPAP45381 313 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 PPP3CCP48454 512 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 NDST1P52848 882 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 USP46P62068 366 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 SPEM2Q0P670 501 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 LRRC32Q14392 662 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 COBLL1Q53SF7 1204 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 LAIR1Q6GTX8 287 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 FAM35AQ86V20 835 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 UNC93AQ86WB7 457 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 RTKNQ9BST9 563 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 RAB23Q9ULC3 237 aa23.1■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 C2orf78A6NCI8 922 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 PSMA7O14818 248 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 CTHP32929 405 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 CXCL12P48061 93 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 MXI1P50539 228 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 CACNA2D1P54289 1103 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 LRRC63Q05C16 580 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 ORC1Q13415 861 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 WDR44Q5JSH3 913 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 PRR23BQ6ZRT6 265 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 SPATA20Q8TB22 786 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 KRT82Q9NSB4 513 aa23.09■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 DCDC2BA2VCK2 349 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 AP1G2O75843 785 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 YWHAQP27348 245 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 DMWDQ09019 674 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 TAF10Q12962 218 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 MTF1Q14872 753 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 PDGFRLQ15198 375 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 ISM2Q6H9L7 571 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 NUP93Q8N1F7 819 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 SLC22A12Q96S37 553 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 EBF3Q9H4W6 596 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
NME4-201ENST00000219479 CCDC130P13994 396 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 PFKLP17858 780 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 CD58P19256 250 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 PPP1R2P41236 205 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 AMPD2Q01433 879 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 RUNX3Q13761 415 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 SPEM1Q8N4L4 309 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 SLC2A14Q8TDB8 520 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 SH3RF2Q8TEC5 729 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 FBXO32Q969P5 355 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 KCNK16Q96T55 309 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 NT5C1AQ9BXI3 368 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 TMEM30AQ9NV96 361 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 GCNT4Q9P109 453 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 CHD8Q9HCK8 2581 aa23.07■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 ZNF840PA6NDX5 716 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 RETP07949 1114 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 IFNAR2P48551 515 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 FNTBP49356 437 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 PON2Q15165 354 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 ZNF77Q15935 545 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 TXNDC11Q6PKC3 985 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 Q6ZS52 159 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 FUKQ8N0W3 1084 aa23.06■■□□□ 1.28
NME4-201ENST00000219479 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms