RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218652.11

NDFIP2-201, Transcript of Nedd4 family interacting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDFIP2, Length 4,625 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2-201ENST00000218652 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 MAFGO15525 162 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 B3GAT3O94766 335 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 CALB2P22676 271 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 CDC42EP1Q00587 391 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 CDC16Q13042 620 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 RNF148Q8N7C7 305 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 DDI1Q8WTU0 396 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 HDAC7Q8WUI4 952 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ZNRF3Q9ULT6 936 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 NEO1Q92859 1461 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 GH1P01241 217 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 JCHAINP01591 159 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 LINC00523Q86TU6 105 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 TADA1Q96BN2 335 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ERAP1Q9NZ08 941 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 GZMAP12544 262 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ATP6V1B2P21281 511 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 HPCAP84074 193 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 SV2CQ496J9 727 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ARHGAP17Q68EM7 881 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 PRR5LQ6MZQ0 368 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ACTRT1Q8TDG2 376 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC20A1Q8WUM9 679 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 GLMNQ92990 594 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 NAT9Q9BTE0 207 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 TMEM39BQ9GZU3 492 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 CAPN10Q9HC96 672 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.48■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 OGTO15294 1046 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 PSTPIP1O43586 416 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 TIMM44O43615 452 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 HBP1O60381 514 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ENDOD1O94919 500 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 RFX3P48380 749 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 LRRC8DQ7L1W4 858 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 DCDC2Q9UHG0 476 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ACOT9Q9Y305 439 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 CPA3P15088 417 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 DEFB107AQ8IZN7 70 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ZNF333Q96JL9 665 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 UBP1Q9NZI7 540 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 WHRNQ9P202 907 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 TSPAN3O60637 253 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 PYGMP11217 842 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 FDFT1P37268 417 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 AGKQ53H12 422 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 STRA8Q7Z7C7 330 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 MED14O60244 1454 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 PLA2R1Q13018 1463 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 CYP2C8P10632 490 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 PTPN4P29074 926 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 TAF6P49848 677 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 PEX5P50542 639 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 NFYCQ13952 458 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 NUDT18Q6ZVK8 323 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 CHMP1BQ7LBR1 199 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.47■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 FAM172AQ8WUF8 416 aa15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 FAM151AQ8WW52 585 aa15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 MAP3K14Q99558 947 aa15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 NMRK2Q9NPI5 230 aa15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ZSCAN32Q9NX65 697 aa15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 C19orf81C9J6K1 198 aa15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 H0YC42 278 aa15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 VWA5AO00534 786 aa15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 CAPZA2P47755 286 aa15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 HARS2P49590 506 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC38A7Q9NVC3 462 aa15.46■□□□□ 0.07
NDFIP2-201ENST00000218652 O00370 1275 aa15.46■□□□□ 0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 SLC26A4O43511 780 aa15.46■□□□□ 0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 HSMCR30P0CW71 290 aa15.46■□□□□ 0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 CYP51A1Q16850 503 aa15.46■□□□□ 0.06
NDFIP2-201ENST00000218652 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms