RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000100237.3

Ttf1-201, Transcript of Transcription termination factor 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ttf1, Length 4,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1-201ENSMUST00000100237 RelaQ04207 549 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 PRAG1Q571I4 1179 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ptk6Q64434 451 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zrsr1Q64707 428 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Kcnk18Q6VV64 394 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fbxo10Q7TQF2 950 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Q8BGN9 141 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Krt75Q8BGZ7 551 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Kbtbd3Q8BHI4 607 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 CenpuQ8C4M7 410 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Parp10Q8CIE4 960 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 HyiQ8R1F5 277 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zcchc18Q8VD24 393 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Pcdhga11Q91XY8 933 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ppp2r2dQ925E7 453 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Prl7c1Q9CRB5 251 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 QpctQ9CYK2 362 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nde1Q9CZA6 344 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gyg1Q9R062 333 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tnni1Q9WUZ5 187 aa7.16□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Bpifb9bA2AJD1 591 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tlk2O55047 718 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Alkbh1P0CB42 389 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tac1P41539 130 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ankmy2Q3TPE9 440 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gprin1Q3UNH4 932 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zbtb8osQ505B7 168 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Kcnj11Q61743 390 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Sh3gl2Q62420 352 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Bpifb9aQ80XI7 591 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fbxo28Q8BIG4 368 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 NcaphQ8C156 731 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fam118bQ8C569 351 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fam221bQ8C627 487 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Snx8Q8CFD4 459 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Krtcap3Q8K177 240 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Klhl36Q8R124 613 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ppp1r16bQ8VHQ3 568 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 IrgqQ8VIM9 583 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ubiad1Q9DC60 336 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 BcamQ9R069 622 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rfwd2Q9R1A8 733 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Slfn14V9GXG1 899 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mon2Q80TL7 1715 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Abcb11Q9QY30 1321 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f15A0A087WR44 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f12A0A0A0MQP3 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f9A2BFZ7 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f7A2BHG6 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f19A2CG71 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f10A2CG92 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f3A2CGC2 496 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Flvcr1B2RXV4 560 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f13B8JKF6 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Lonrf1D3YY23 762 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zfp780bE9Q2S6 806 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm20721E9Q2U8 318 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f2J3QMS5 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f25J3QMV9 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f6J3QMW9 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f26J3QNK2 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f24J3QNQ5 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f8J3QQ50 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f17L7MU81 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f18L7MU83 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm3424L7N298 263 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm8246M0QWX9 263 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Chil3O35744 398 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nptx2O70340 429 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ptpn12P35831 775 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Usp10P52479 792 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f14Q1LZI5 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Dennd1bQ3U1T9 766 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mif4gdQ3UBZ5 222 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Btbd35f27Q5FWA1 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Wdr91Q7TMQ7 748 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ip6k2Q80V72 448 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Usp6nlQ80XC3 819 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Frmd4aQ8BIE6 1020 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fra10ac1Q8BP78 315 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Shisa4Q8CA71 197 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Trmt6Q8CE96 497 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Serpinb10Q8K1K6 397 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Dcaf8Q8N7N5 591 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Atp6v1b1Q91YH6 513 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Dqx1Q924H9 718 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 GMCL1P1Q99N64 498 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 CacybpQ9CXW3 229 aa7.15□□□□□ -1.26
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Slc6a16A0A1L1SR47 742 aa7.15□□□□□ -1.27
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Akap5D3YVF0 745 aa7.15□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.2 ms