RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	COX12	Q01519	83 aa		-0.96	□□□□□ -2.56
BLI1	YKL061W	PMD1	P32634	1753 aa		-0.96	□□□□□ -2.56
BLI1	YKL061W	YER187W	P40102	141 aa		-0.97	□□□□□ -2.56
BLI1	YKL061W	CSN9	Q03981	162 aa		-0.97	□□□□□ -2.56
BLI1	YKL061W	ICY1	Q04329	127 aa		-0.97	□□□□□ -2.56
BLI1	YKL061W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	-0.98	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	-0.98	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	PAU19	P0CE85	124 aa		-0.98	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	PAU3	P25610	124 aa		-0.98	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	POP7	P38291	140 aa		-0.98	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	SFT1	P43682	97 aa		-0.98	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	-0.98	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	YGR025W	P53216	100 aa		-0.98	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	MRX7	P53869	86 aa		-0.98	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	YBR292C	P38357	123 aa		-0.99	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	DAD1	Q12248	94 aa		-0.99	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	YLR118C	Q12354	227 aa		-0.99	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		-0.99	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	SSN2	P38931	1420 aa		-0.99	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	-1	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	TDA2	P40045	126 aa		-1	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	PAU15	P40585	124 aa		-1	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	SAE3	P89114	91 aa		-1	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	-1.01	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	-1.01	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	YGL204C	P53089	101 aa		-1.01	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	SPC24	Q04477	213 aa		-1.01	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	PAU20	Q08322	120 aa		-1.01	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		-1.01	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	YCR099C	P25657	155 aa		-1.02	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	PAU16	P35994	123 aa		-1.02	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	-1.02	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	GTT1	P40582	234 aa		-1.02	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	HKR1	P41809	1802 aa		-1.02	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		-1.02	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	SRB8	P25648	1427 aa		-1.03	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	MIX14	Q04341	121 aa		-1.03	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		-1.03	□□□□□ -2.57
BLI1	YKL061W	BUD4	P47136	1447 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	PAU6	P0CE90	120 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	PAU18	P0CE91	120 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	MRP17	P28778	131 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	-1.04	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	BPH1	P25356	2167 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	-1.05	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	ECM12	O13529	151 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	COX7	P10174	60 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	YBL044W	P38194	122 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	SNA2	P56508	79 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	YDR278C	Q05612	105 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	CSF1	Q12150	2958 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	CHD1	P32657	1468 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	NUM1	Q00402	2748 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	SRB6	P32570	121 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	TIM8	P57744	87 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	-1.08	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	RPB11	P38902	120 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	PAU1	P0CE88	120 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	PAU14	P0CE89	120 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	PAU8	P0CE92	120 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	PAU11	P0CE93	120 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	ROX3	P25046	220 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	PAU13	P38725	120 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	AIM19	P40502	157 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	HUR1	P45820	110 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	APS2	Q00381	147 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	PAU10	Q03050	120 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	PAU9	Q3E770	120 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	MIC10	Q96VH5	97 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
BLI1	YKL061W	YBL071C	P38185	102 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	YAR029W	P39549	74 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	-1.1	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	PAU5	P43575	122 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	NKP2	Q06162	153 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	YLR042C	Q07990	161 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	-1.1	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	VMA21	P41806	77 aa		-1.11	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	MMS1	Q06211	1407 aa		-1.12	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	TOM6	P33448	61 aa		-1.12	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	PAU4	P53427	120 aa		-1.12	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	NTE1	Q04958	1679 aa		-1.13	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	MRP49	P32388	137 aa		-1.13	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	-1.13	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	SDH6	Q3E785	79 aa		-1.13	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		-1.13	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	SWC7	Q06707	132 aa		-1.14	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	SPC1	P46965	94 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	TLG1	Q03322	224 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	YHR050W-A	Q05451	56 aa		-1.15	□□□□□ -2.59
BLI1	YKL061W	KRE5	P22023	1365 aa		-1.16	□□□□□ -2.59

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.5 ms