RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W ENV10Q99382 181 aa2.94□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W SSS1P35179 80 aa2.94□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W OST3P48439 350 aa2.94□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YCR007CP25354 239 aa2.93□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YDL241WQ07738 123 aa2.93□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W ADH2P00331 348 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W APS1P35181 156 aa2.93□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YLR112WQ12130 139 aa2.93□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YMR175W-AQ3E766 64 aa2.93□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa2.93□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YPL229WQ99395 206 aa2.93□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YER134CP40081 178 aa2.92□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W RPC10P40422 70 aa2.92□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W BET5Q03630 159 aa2.92□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W FYV7Q12247 151 aa2.92□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W COA3Q3E7B2 85 aa2.92□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W POP3P53833 195 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YKL044WP36092 106 aa2.91□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YMR320WQ04897 101 aa2.91□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W PBA1Q05778 276 aa2.91□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YPR014CQ6B0W2 109 aa2.91□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YKL070WP36087 169 aa2.91□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YLR194CQ05777 254 aa2.91□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YCL021W-AQ96VH3 125 aa2.91□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W PRE1P22141 198 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W AIM29P36154 155 aa2.9□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W YEL008WP40001 126 aa2.9□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W PEX17P40155 199 aa2.9□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W PPT2Q12036 173 aa2.9□□□□□ -1.94
SPC105YGL093W HMRA2P0CY13 119 aa2.9□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YPT53P36019 220 aa2.9□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YIL059CP40520 121 aa2.9□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YDR115WQ04598 105 aa2.9□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W QCR8P08525 94 aa2.89□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W HAP3P13434 144 aa2.89□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YMR103CQ04436 120 aa2.89□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YBR209WP38311 105 aa2.88□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W HAC1P41546 238 aa2.88□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W LSM8P47093 109 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YIL134C-AQ45U18 67 aa2.88□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W TOA2P32774 122 aa2.87□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W SHU1P38751 150 aa2.87□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YGL230CP53074 147 aa2.87□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data2.87□□□□□ -1.95not detected
SPC105YGL093W ATP5P09457 212 aa2.86□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W SEC11P15367 167 aa2.86□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W SVP26P38869 228 aa2.86□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W COX14P39103 70 aa2.86□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W CIN5P40917 295 aa2.86□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W ANB1P19211 157 aa2.86□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W RPL32P38061 130 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W RPF1P38805 295 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W IGO2Q9P305 131 aa2.86□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YAR023CD6VPM8 179 aa2.85□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YAL065CO13511 128 aa2.85□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W MBF1O14467 151 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W AIM11P87275 137 aa2.85□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YMR295CQ03559 197 aa2.85□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YPL261CQ08976 102 aa2.85□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W DIF1O13577 133 aa2.85□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YBR219CP38317 127 aa2.85□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YGL041C-BQ3E750 60 aa2.85□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W ADH1P00330 348 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W ATP15P21306 62 aa2.84□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YKR041WP36134 250 aa2.84□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YGL088WP53151 121 aa2.84□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W SCS22Q6Q595 175 aa2.84□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W MRP10O75012 95 aa2.84□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W STF1P01098 86 aa2.84□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W YPL073CP40323 161 aa2.84□□□□□ -1.95
SPC105YGL093W FUN14P18411 198 aa2.83□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W MRPL44P19956 98 aa2.83□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W YER085CP40058 173 aa2.83□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W YDL157CQ12082 118 aa2.83□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W GAT4P40569 121 aa2.83□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W PAU23Q07987 124 aa2.83□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W YDR029WQ12111 104 aa2.83□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W PAU17Q12370 124 aa2.83□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W YAL064WP39711 94 aa2.83□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W YML079WQ03629 201 aa2.83□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W YOR020W-AQ3E824 90 aa2.83□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W YDR034C-AP0C289 58 aa2.82□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W SEN15Q04675 128 aa2.82□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W CWP2P43497 92 aa2.82□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W MRPS12P53732 153 aa2.82□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W ABF2Q02486 183 aa2.82□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W YBL039W-BP0C268 59 aa2.81□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W AQY2P0CD90 149 aa2.81□□□□□ -1.96
SPC105YGL093W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.8 ms