RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	STK39	Q9UEW8	545 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	MSRA	Q9UJ68	235 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	PATJ	Q8NI35	1801 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	HHLA1	C9JL84	531 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SOAT2	O75908	522 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	RAB30	Q15771	203 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	STK32A	Q8WU08	396 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	EPOP	A6NHQ4	379 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	HIDE1	A8MVS5	230 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421		F8VP50	259 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	IRS1	P35568	1242 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	GABRB2	P47870	512 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	GPR15	P49685	360 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	GPC5	P78333	572 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	KIF5A	Q12840	1032 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	XYLT1	Q86Y38	959 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	GPR65	Q8IYL9	337 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SAMD11	Q96NU1	681 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	TLR9	Q9NR96	1032 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	FNIP2	Q9P278	1114 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	COG5	Q9UP83	839 aa		18.73	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	NCAN	O14594	1321 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ESPN	B1AK53	854 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ABLIM3	O94929	683 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	GJB6	O95452	261 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CXCL14	O95715	111 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CYP1A2	P05177	515 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CA8	P35219	290 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	UBE3A	Q05086	875 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ADCY1	Q08828	1119 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	DUSP4	Q13115	394 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM110	Q86TL2	294 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	STKLD1	Q8NE28	680 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	MYO9B	Q13459	2157 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421		H3BNC9	293 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SEC24A	O95486	1093 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	RAB33A	Q14088	237 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	DDR2	Q16832	855 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	C18orf8	Q96DM3	657 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	NOX5	Q96PH1	765 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ABCB6	Q9NP58	842 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	IRAK3	Q9Y616	596 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	FSCN2	O14926	492 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	BUB1	O43683	1085 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CALB1	P05937	261 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	LCP1	P13796	627 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	NDUFV1	P49821	464 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC8A3	P57103	927 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ADIG	Q0VDE8	80 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	GPM6B	Q13491	265 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	RFFL	Q8WZ73	363 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	HSFY1	Q96LI6	401 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	TRIM7	Q9C029	511 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SYNC	Q9H7C4	482 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	EYS	Q5T1H1	3165 aa		18.71	■□□□□ 0.58
SPIN3-238	ENST00000640421	PLXNA3	P51805	1871 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SPIN3-238	ENST00000640421	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SPIN3-238	ENST00000640421	KRT86	O43790	486 aa		18.7	■□□□□ 0.58

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