RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZXDBP98169 803 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP24A1Q07973 514 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 EHHADHQ08426 723 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 PSMD6Q15008 389 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 UNC13DQ70J99 1090 aa22.18■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 KBTBD6Q86V97 674 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 EXOC4Q96A65 974 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.18■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 FNBP1Q96RU3 617 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.18■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 SNX25Q9H3E2 840 aa22.17■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 F8VP50 259 aa22.16■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF516Q92618 1163 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 LOXL4Q96JB6 756 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 LAMA1P25391 3075 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 LEFTY2O00292 366 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 PFKLP17858 780 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 CACNA2D1P54289 1103 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.15■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-208ENST00000616074 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACDQ96AP0 544 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 RNF38Q9H0F5 515 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 EHD2Q9NZN4 543 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF806P0C7X5 589 aa22.13■■□□□ 1.13
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TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC7A9P82251 487 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRPC3Q13507 836 aa22.13■■□□□ 1.13
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TRAPPC3-208ENST00000616074 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.13■■□□□ 1.13
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.13■■□□□ 1.13
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TRAPPC3-208ENST00000616074 CPQQ9Y646 472 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 A8MXQ7 604 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 CLDN5O00501 218 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 APBB3O95704 486 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 ABL1P00519 1130 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 AFMP43652 599 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP3CCP48454 512 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 CASP4P49662 377 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 TAF10Q12962 218 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 GAB4Q2WGN9 574 aa22.12■■□□□ 1.13
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