RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 TNK2Q07912 1038 aa20.58■□□□□ 0.89
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SGMS1-208ENST00000608287 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.53■□□□□ 0.88
SGMS1-208ENST00000608287 HPDLQ96IR7 371 aa20.53■□□□□ 0.88
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SGMS1-208ENST00000608287 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SGMS1-208ENST00000608287 SMC2O95347 1197 aa20.52■□□□□ 0.88
SGMS1-208ENST00000608287 VNN2O95498 520 aa20.52■□□□□ 0.88
SGMS1-208ENST00000608287 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SGMS1-208ENST00000608287 CASP4P49662 377 aa20.52■□□□□ 0.88
SGMS1-208ENST00000608287 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SGMS1-208ENST00000608287 CEP135Q66GS9 1140 aa20.52■□□□□ 0.88
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