RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 GLUD2P49448 558 aa8.35□□□□□ -1.07
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ZNF548-208ENST00000597576 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.34□□□□□ -1.07
ZNF548-208ENST00000597576 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.34□□□□□ -1.07
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ZNF548-208ENST00000597576 NRP1O14786 923 aa8.34□□□□□ -1.07
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ZNF548-208ENST00000597576 KCNJ18B7U540 433 aa8.33□□□□□ -1.08
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ZNF548-208ENST00000597576 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ZNF548-208ENST00000597576 ITGB3P05106 788 aa8.33□□□□□ -1.08
ZNF548-208ENST00000597576 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
ZNF548-208ENST00000597576 HOXA9P31269 272 aa8.33□□□□□ -1.08
ZNF548-208ENST00000597576 CASP4P49662 377 aa8.33□□□□□ -1.08
ZNF548-208ENST00000597576 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ZNF548-208ENST00000597576 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ZNF548-208ENST00000597576 MYL7Q01449 175 aa8.33□□□□□ -1.08
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