RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		28.59	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		28.59	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	USP17L7	P0C7H9	530 aa		28.59	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC130	P13994	396 aa		28.59	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	PPP3CC	P48454	512 aa		28.59	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		28.59	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	NUP93	Q8N1F7	819 aa		28.59	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		28.59	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	TDP1	Q9NUW8	608 aa		28.59	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	LRRN2	O75325	713 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	CILP	O75339	1184 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	PRAMEF12	O95522	483 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	ABL1	P00519	1130 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	CKM	P06732	381 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC192	P0DO97	292 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	ADORA2B	P29275	332 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	FMO5	P49326	533 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	PTPN5	P54829	565 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	PLCB2	Q00722	1185 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	FUK	Q8N0W3	1084 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		28.58	■■■□□ 2.17
BRD4-208	ENST00000597315	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	PTPRD	P23468	1912 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	MAN2B1	O00754	1011 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	PI15	O43692	258 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	TADA3	O75528	432 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	FAM200B	P0CF97	657 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	YWHAQ	P27348	245 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	CACNA2D1	P54289	1103 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	USP46	P62068	366 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF394	Q53GI3	561 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	C12orf29	Q8N999	325 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	MLKL	Q8NB16	471 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	TTC16	Q8NEE8	873 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	KCNK16	Q96T55	309 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	NELL2	Q99435	816 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	NCAM2	O15394	837 aa		28.56	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		28.56	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	PJA1	Q8NG27	643 aa		28.56	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	TATDN2	Q93075	761 aa		28.56	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	FBXO32	Q969P5	355 aa		28.56	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	FOXQ1	Q9C009	403 aa		28.56	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	CISH	Q9NSE2	258 aa		28.56	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		28.56	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	DACH1	Q9UI36	760 aa		28.56	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	28.56	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	NCAN	O14594	1321 aa		28.55	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	HDC	P19113	662 aa		28.55	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	LRMP	Q12912	555 aa		28.55	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	TAF10	Q12962	218 aa		28.55	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		28.55	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	PRSS33	Q8NF86	280 aa		28.55	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	TWNK	Q96RR1	684 aa		28.55	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		28.55	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		28.55	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	P4HA2	O15460	535 aa		28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	PFKL	P17858	780 aa		28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	CD72	P21854	359 aa		28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	MAP3K7CL	P57077	242 aa		28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	CUL2	Q13617	745 aa		28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	NT5C1B	Q96P26	610 aa		28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	COMMD8	Q9NX08	183 aa		28.54	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	FAM170B	A6NMN3	283 aa		28.53	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	GLUL	P15104	373 aa		28.53	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	SLC5A3	P53794	718 aa		28.53	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		28.53	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		28.53	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	WHAMM	Q8TF30	809 aa		28.53	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		28.53	■■■□□ 2.16
BRD4-208	ENST00000597315	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		28.53	■■■□□ 2.16

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