RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 TNFRSF10BO14763 440 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 GDI1P31150 447 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 PRKCQQ04759 706 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 LMO3Q8TAP4 145 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 GPT2Q8TD30 523 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 IRF7Q92985 503 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 SMOQ99835 787 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 MED10Q9BTT4 135 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 CISHQ9NSE2 258 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 IL37Q9NZH6 218 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 GCNT4Q9P109 453 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF263O14978 683 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 CHADO15335 359 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 AP1G2O75843 785 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 BEST1O76090 585 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 NUP93Q8N1F7 819 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 TTC39CQ8N584 583 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 SHDQ96IW2 340 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 SLC22A12Q96S37 553 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 HEBP1Q9NRV9 189 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 KRT82Q9NSB4 513 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 EHD2Q9NZN4 543 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 CCL26Q9Y258 94 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 DENND4CQ5VZ89 1909 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN6-206ENST00000590466 COL4A3Q01955 1670 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 C2orf78A6NCI8 922 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF840PA6NDX5 716 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 DPYSL4O14531 572 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 P4HA2O15460 535 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 AVPR1AP37288 418 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 NUBP1P53384 320 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 RAD23BP54727 409 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 KCNH2Q12809 1159 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 CUL2Q13617 745 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 PRSS33Q8NF86 280 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 RIN3Q8TB24 985 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 BPIFB1Q8TDL5 484 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 TDP1Q9NUW8 608 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 OBSL1O75147 1896 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 FAM92AA1XBS5 289 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 PPP3CCP48454 512 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 TAF10Q12962 218 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF394Q53GI3 561 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 UBR7Q8N806 425 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 SLC4A11Q8NBS3 891 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 FOXQ1Q9C009 403 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 COL4A2P08572 1712 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 HHLA1C9JL84 531 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 STK25O00506 426 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC192P0DO97 292 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 PFKLP17858 780 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 YWHAQP27348 245 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 ADORA2BP29275 332 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 SLC5A3P53794 718 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 TPRG1Q6ZUI0 275 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 YAF2Q8IY57 180 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 PJA1Q8NG27 643 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 TMEM176AQ96HP8 235 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 PRRX2Q99811 253 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 COMMD8Q9NX08 183 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 USP17L7P0C7H9 530 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 FAM200BP0CF97 657 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 CD72P21854 359 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 MAP3K7CLP57077 242 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 TCF15Q12870 199 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 LRMPQ12912 555 aa21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
UBXN6-206ENST00000590466 CLEC20AQ6ZU45 233 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms