RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 USP17L7P0C7H9 530 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 GCLMP48507 274 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 FAM160A1Q05DH4 1040 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ADAM9Q13443 819 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 RUNX3Q13761 415 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 GAS6Q14393 721 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 Q6ZS52 159 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ACOT1Q86TX2 421 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 MSANTD3Q96H12 275 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 C8orf48Q96LL4 319 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 FAM83CQ9BQN1 747 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 GCNT4Q9P109 453 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ATG2BQ96BY7 2078 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 IKBKBO14920 756 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 KRT13P13646 458 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 HDCP19113 662 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 NDST1P52848 882 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 PPP3CAQ08209 521 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 MTF1Q14872 753 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ZNF528Q3MIS6 628 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 FAM35AQ86V20 835 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 CCDC34Q96HJ3 373 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 TNIP3Q96KP6 325 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 KCNK16Q96T55 309 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 WNT6Q9Y6F9 365 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 MYH10P35580 1976 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 SOBPA7XYQ1 873 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 MAPK13O15264 365 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 KINO60870 393 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ASS1P00966 412 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 P4HA1P13674 534 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 RPL13P26373 211 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 SATB1Q01826 763 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 TAF10Q12962 218 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 LRRC32Q14392 662 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ZNF77Q15935 545 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 NFIL3Q16649 462 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ZCWPW2Q504Y3 356 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 C1orf228Q6PIY5 440 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 PAQR9Q6ZVX9 377 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ENGASEQ8NFI3 743 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 HINFPQ9BQA5 517 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 TTLL2Q9BWV7 592 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 SEMA4AQ9H3S1 761 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 FAM49BQ9NUQ9 324 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ZSCAN32Q9NX65 697 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ATP8B3O60423 1300 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ZNF840PA6NDX5 716 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 CCDC130P13994 396 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 PRCPP42785 496 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ASPAP45381 313 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 IFNAR2P48551 515 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 CCR3P51677 355 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 NOP14P78316 857 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 USP4Q13107 963 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 NUP93Q8N1F7 819 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 TAF4BQ92750 862 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 CHFRQ96EP1 664 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 CEP295NLQ96MC4 621 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 KRT82Q9NSB4 513 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 SMPD4Q9NXE4 827 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 EHD2Q9NZN4 543 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 GPR179Q6PRD1 2367 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 HELZP42694 1942 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 VPS13AQ96RL7 3174 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 USP34Q70CQ2 3546 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 AP1G2O75843 785 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 YWHAQP27348 245 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ADORA2BP29275 332 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 HOXC13P31276 330 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 CXCL12P48061 93 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ZXDBP98169 803 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 PDGFRLQ15198 375 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 DGKKQ5KSL6 1271 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 ISM2Q6H9L7 571 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 FUKQ8N0W3 1084 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 SPEM1Q8N4L4 309 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-203ENST00000587752 C12orf29Q8N999 325 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms