RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586654.5

EFTUD2-206, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 585 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-206	ENST00000586654	VNN2	O95498	520 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	HLA-DRA	P01903	254 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ODC1	P11926	461 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	SOX5	P35711	763 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	CCR2	P41597	374 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	KIF11	P52732	1056 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	JAM2	P57087	298 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ARID5A	Q03989	594 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	GPR17	Q13304	367 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	TRPC3	Q13507	836 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ZACN	Q401N2	412 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	GJB7	Q6PEY0	223 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	POTEH	Q6S545	545 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	LMO3	Q8TAP4	145 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	DPP3	Q9NY33	737 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	MTMR11	A4FU01	709 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ECI2	O75521	394 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	GFPT2	O94808	682 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	CYP11A1	P05108	521 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	MYL4	P12829	197 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	TNNT1	P13805	278 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	PRKCI	P41743	596 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	TAF6	P49848	677 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	EPHA5	P54756	1037 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	STARD6	P59095	220 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	PFKP	Q01813	784 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	DUSP4	Q13115	394 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	PLD1	Q13393	1074 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	LEMD2	Q8NC56	503 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	SHD	Q96IW2	340 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	TMEM209	Q96SK2	561 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ASAH2	Q9NR71	780 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	DSE	Q9UL01	958 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	PTPRJ	Q12913	1337 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	PROB1	E7EW31	1015 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	CYB561D2	O14569	222 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	KRT86	O43790	486 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	KIF5C	O60282	957 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	LRRN2	O75325	713 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	MOSPD3	O75425	235 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	GJA1	P17302	382 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	FCAR	P24071	287 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	USP8	P40818	1118 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	EPHB3	P54753	998 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	WNT7B	P56706	349 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	GCNT1	Q02742	428 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	PRKCQ	Q04759	706 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	NCOA4	Q13772	614 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ANGPT1	Q15389	498 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	METTL23	Q86XA0	190 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	PJA1	Q8NG27	643 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	ZNF516	Q92618	1163 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	SEMA4D	Q92854	862 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFTUD2-206	ENST00000586654	FOXQ1	Q9C009	403 aa		10.41	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms