RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	RSC1A1	Q92681	617 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	EDA	Q92838	391 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	GJD2	Q9UKL4	321 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	PNMA2	Q9UL42	364 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TOM1L1-222	ENST00000575909	GAGE12B	A1L429	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909		F5H697	171 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	NCAM2	O15394	837 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	ELANE	P08246	267 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	CD6	P30203	668 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRKAR1B	P31321	381 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	TXK	P42681	527 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	CXADR	P78310	365 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCNI	Q14094	377 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	TAF12	Q16514	161 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	TIGD6	Q17RP2	521 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	ICE2	Q659A1	982 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	SNX19	Q92543	992 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	RUBCN	Q92622	972 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	TEPSIN	Q96N21	525 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A0B4J269	797 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	FCHO1	O14526	889 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	USP1	O94782	785 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	VIP	P01282	170 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	AR	P10275	920 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	GPS1	Q13098	491 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	TUBB3	Q13509	450 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	BOD1	Q96IK1	185 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	RTKN	Q9BST9	563 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	PDP2	Q9P2J9	529 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	AHRR	A9YTQ3	701 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	PCDH17	O14917	1159 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACTL6B	O94805	426 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	CSF1R	P07333	972 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	PTMS	P20962	102 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	BCAT1	P54687	386 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	CYP2A13	Q16696	494 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	TEX101	Q9BY14	249 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TOM1L1-222	ENST00000575909	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25

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