RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYRFLQ96LU7 910 aa35.06■■■■□ 3.2
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ADHFE1Q8IWW8 467 aa35.05■■■■□ 3.2
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CCR2P41597 374 aa35.04■■■■□ 3.2
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa35.02■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPAG5Q96R06 1193 aa35.02■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTLL2Q9BWV7 592 aa35.02■■■■□ 3.2
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MED7O43513 233 aa35.01■■■■□ 3.2
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GAREM2Q75VX8 874 aa35.01■■■■□ 3.2
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DENND4CQ5VZ89 1909 aa34.98■■■■□ 3.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0QYV0 167 aa34.97■■■■□ 3.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
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