RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 GCNT4Q9P109 453 aa23.94■■□□□ 1.42
CLN3-215ENST00000565236 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa23.94■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa23.93■■□□□ 1.42
CLN3-215ENST00000565236 PTPRDP23468 1912 aa23.93■■□□□ 1.42
CLN3-215ENST00000565236 C2orf78A6NCI8 922 aa23.93■■□□□ 1.42
CLN3-215ENST00000565236 LILRB5O75023 590 aa23.93■■□□□ 1.42
CLN3-215ENST00000565236 ZNF202O95125 648 aa23.93■■□□□ 1.42
CLN3-215ENST00000565236 VNN1O95497 513 aa23.93■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa23.93■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.93■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.93■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 RAP1GAPP47736 663 aa23.92■■□□□ 1.42
CLN3-215ENST00000565236 PPP3CCP48454 512 aa23.92■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 Q6ZS52 159 aa23.92■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.92■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 PFKLP17858 780 aa23.91■■□□□ 1.42
CLN3-215ENST00000565236 IFNAR2P48551 515 aa23.91■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 ZACNQ401N2 412 aa23.91■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 SH3RF2Q8TEC5 729 aa23.91■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.9■■□□□ 1.42
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CLN3-215ENST00000565236 ZNF840PA6NDX5 716 aa23.89■■□□□ 1.41
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CLN3-215ENST00000565236 TAF10Q12962 218 aa23.89■■□□□ 1.41
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CLN3-215ENST00000565236 NFIL3Q16649 462 aa23.89■■□□□ 1.41
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CLN3-215ENST00000565236 FSTL4Q6MZW2 842 aa23.88■■□□□ 1.41
CLN3-215ENST00000565236 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CLN3-215ENST00000565236 ACOT1Q86TX2 421 aa23.88■■□□□ 1.41
CLN3-215ENST00000565236 KCNK16Q96T55 309 aa23.88■■□□□ 1.41
CLN3-215ENST00000565236 RAB23Q9ULC3 237 aa23.88■■□□□ 1.41
CLN3-215ENST00000565236 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CLN3-215ENST00000565236 ASS1P00966 412 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CLN3-215ENST00000565236 HLA-DRAP01903 254 aa23.87■■□□□ 1.41
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