RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 RTN2O75298 545 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 BEST1O76090 585 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 VNN2O95498 520 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 CACNA2D1P54289 1103 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 MAP3K7CLP57077 242 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 SPA17Q15506 151 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 ACAD10Q6JQN1 1059 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 SMOQ99835 787 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 ABCB6Q9NP58 842 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 MUC3AQ02505 3323 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 RFXAPO00287 272 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 TULP2O00295 520 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 ATF2P15336 505 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 KLRC2P26717 231 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 MAGEA11P43364 429 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 DUSP4Q13115 394 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 HS1BP3Q53T59 392 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 VSTM1Q6UX27 236 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 NOX5Q96PH1 765 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 KCNK16Q96T55 309 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 DESI2Q9BSY9 194 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 GRIK1P39086 918 aa20.23■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 ADGRE1Q14246 886 aa20.23■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.23■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 PMF1Q6P1K2 205 aa20.23■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.23■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.23■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 ISCUQ9H1K1 167 aa20.23■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.23■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.23■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.23■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 F8VP50 259 aa20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 FTLP02792 175 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 MAGEA1P43355 309 aa20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 PLA2G4AP47712 749 aa20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 RGS7P49802 495 aa20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 KRT83P78385 493 aa20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 PDCLQ13371 301 aa20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 PIGZQ86VD9 579 aa20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 ERICH1Q86X53 443 aa20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 ST7Q9NRC1 585 aa20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.22■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 TRIM66O15016 1216 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 TGM5O43548 720 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 SEC24AO95486 1093 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 ELF1P32519 619 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 PTPROQ16827 1216 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 STK32AQ8WU08 396 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 CPXM1Q96SM3 734 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 PYCARDQ9ULZ3 195 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 GALCP54803 685 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 LILRA6Q6PI73 481 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 MON1BQ7L1V2 547 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 HSFY1Q96LI6 401 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 C8orf48Q96LL4 319 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 SYNCQ9H7C4 482 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 MAFFQ9ULX9 164 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-204ENST00000564105 TTC28Q96AY4 2481 aa20.2■□□□□ 0.82
CTU2-204ENST00000564105 HHLA1C9JL84 531 aa20.2■□□□□ 0.82
CTU2-204ENST00000564105 PIK3R2O00459 728 aa20.2■□□□□ 0.82
CTU2-204ENST00000564105 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CTU2-204ENST00000564105 SOAT2O75908 522 aa20.2■□□□□ 0.82
CTU2-204ENST00000564105 GLUD1P00367 558 aa20.2■□□□□ 0.82
CTU2-204ENST00000564105 H2AFZP0C0S5 128 aa20.2■□□□□ 0.82
CTU2-204ENST00000564105 SPATA31D3P0C874 917 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms