RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559359.1

PSME2-208, Transcript of proteasome activator subunit 2, human

TSL 2

Gene PSME2, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME2-208	ENST00000559359	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	YAF2	Q8IY57	180 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TTC8	Q8TAM2	541 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	DNASE1L2	Q92874	299 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	HPDL	Q96IR7	371 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	BCO2	Q9BYV7	579 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	GPR88	Q9GZN0	384 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	UBE4B	O95155	1302 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	KLRC4	O43908	158 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PRAMEF12	O95522	483 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SLFN14	P0C7P3	912 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SP9	P0CG40	484 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PFKFB1	P16118	471 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TNNI1	P19237	187 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CYP2F1	P24903	491 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	LMO2	P25791	158 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SOX9	P48436	509 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CASP4	P49662	377 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MYL7	Q01449	175 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CYP24A1	Q07973	514 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SURF1	Q15526	300 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	WDR49	Q8IV35	697 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PAGE5	Q96GU1	130 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SPATA32	Q96LK8	384 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	FNBP1	Q96RU3	617 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ACBD6	Q9BR61	282 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	F5	P12259	2224 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CFAP54	Q96N23	3096 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	FGF19	O95750	216 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CDC25C	P30307	473 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	NLRP12	P59046	1061 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	KRT85	P78386	507 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SMARCB1	Q12824	385 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MYO1E	Q12965	1108 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	STK4	Q13043	487 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PSMD6	Q15008	389 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TSSK4	Q6SA08	328 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MMS19	Q96T76	1030 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PKMYT1	Q99640	499 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CGRRF1	Q99675	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SYT15	Q9BQS2	421 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TASP1	Q9H6P5	420 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	EXOC1	Q9NV70	894 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	ARNTL	O00327	626 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	GABRD	O14764	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	LAMTOR5	O43504	91 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	EXOC3	O60645	756 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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