RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 FUKQ8N0W3 1084 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 GPR152Q8TDT2 470 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 TATDN2Q93075 761 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 IL21Q9HBE4 155 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM49BQ9NUQ9 324 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 NME7Q9Y5B8 376 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNJ18B7U540 433 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 VDRP11473 427 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC130P13994 396 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 NPR3P17342 541 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 ADORA2BP29275 332 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 GPR15P49685 360 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 MYL5Q02045 173 aa16.72■□□□□ 0.27
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RABGGTA-205ENST00000558534 KCNJ12Q14500 433 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 CMTM8Q8IZV2 173 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 FBXO32Q969P5 355 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 PBXIP1Q96AQ6 731 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 MSANTD3Q96H12 275 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 KXD1Q9BQD3 176 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 UBXN6Q9BZV1 441 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 BRD9Q9H8M2 597 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 HELZP42694 1942 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 CLDN5O00501 218 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 GJA1P17302 382 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 PSEN1P49768 467 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 BCAT1P54687 386 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 CYP4F8P98187 520 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 PRKCQQ04759 706 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC142Q17RM4 750 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 VWA3BQ502W6 1294 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF394Q53GI3 561 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 TCP11X2Q5H9J9 407 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 TADA2BQ86TJ2 420 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 KIAA1958Q8N8K9 716 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 C12orf29Q8N999 325 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 WHAMMQ8TF30 809 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 RSAD2Q8WXG1 361 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 PRRX2Q99811 253 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 DUSP16Q9BY84 665 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 NDST4Q9H3R1 872 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 TRPV5Q9NQA5 729 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 MYO16Q9Y6X6 1858 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-205ENST00000558534 TECTAO75443 2155 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 SMTNL1A8MU46 457 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF263O14978 683 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 CAVIN2O95810 425 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 CKMP06732 381 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 CD19P15391 556 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 TUBP50607 506 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 CDR1P51861 262 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 NUBP1P53384 320 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC5A3P53794 718 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 RAD23BP54727 409 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 MAP3K7CLP57077 242 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 TYRO3Q06418 890 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 ORC1Q13415 861 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 FKBP15Q5T1M5 1219 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 TANGO2Q6ICL3 276 aa16.7■□□□□ 0.26
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RABGGTA-205ENST00000558534 IRF2BP1Q8IU81 584 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16.7■□□□□ 0.26
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RABGGTA-205ENST00000558534 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 EXOC4Q96A65 974 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 TWNKQ96RR1 684 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 ARID3AQ99856 593 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 TRPC7Q9HCX4 862 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 TDP1Q9NUW8 608 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM63CQ9P1W3 806 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 HEPACAM2A8MVW5 462 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 CHADO15335 359 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 MED7O43513 233 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 CFHP08603 1231 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGGTA-205ENST00000558534 SETSIPP0DME0 302 aa16.69■□□□□ 0.26
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