RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556749.1

TTC7B-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 4

Gene TTC7B, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-210	ENST00000556749	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PON2	Q15165	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF77	Q15935	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GAB4	Q2WGN9	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	WHAMM	Q8TF30	809 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ACBD6	Q9BR61	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DSE	Q9UL01	958 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TSC2	P49815	1807 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749		A0A087X0B3	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749		H3BQV1	296 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	HCRT	O43612	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	EPN2	O95208	641 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	IL18RAP	O95256	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	OLFM2	O95897	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	EGF	P01133	1207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ARSA	P15289	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GAP43	P17677	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GART	P22102	1010 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CYP2F1	P24903	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PML	P29590	882 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GJA4	P35212	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	HOXD13	P35453	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PNPLA4	P41247	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MAGEA11	P43364	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GALK1	P51570	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CDR1	P51861	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SHC2	P98077	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	USP4	Q13107	963 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RUNX3	Q13761	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	POSTN	Q15063	836 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PDGFRL	Q15198	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DDR2	Q16832	855 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SV2C	Q496J9	727 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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