RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554691.5

PCNX1-207, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCNX1, Length 4,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-207ENST00000554691 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.66□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 GREM2Q9H772 168 aa6.66□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 FANCEQ9HB96 536 aa6.66□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.66□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.66□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.66□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PDZK1P1A8MUH7 402 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 F8W031 263 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 KRT34O76011 436 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 BGNP21810 368 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 COPB2P35606 906 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 BCAMP50895 628 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ACTR3P61158 418 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 MYBPC3Q14896 1274 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TAB1Q15750 504 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 KLHL12Q53G59 568 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TTC23Q5W5X9 447 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 NACA2Q9H009 215 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 FAM205CA6NFA0 338 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 RALAP11233 206 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 RALBP11234 206 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 GCLMP48507 274 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TRAF2Q12933 501 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 CHSY1Q86X52 802 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.65□□□□□ -1.34
PCNX1-207ENST00000554691 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 A0A0U1RQJ8 604 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 CCDC78A2IDD5 438 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 PROSCO94903 275 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 DAB2P98082 770 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 FOXO4P98177 505 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 IL1RL1Q01638 556 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 CDC16Q13042 620 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 PRKAA1Q13131 559 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 PICALMQ13492 652 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 LLGL1Q15334 1064 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 MIIPQ5JXC2 388 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 FNDC8Q8TC99 324 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 C7orf26Q96N11 449 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 BIRC8Q96P09 236 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 CYLDQ9NQC7 956 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 USE1Q9NZ43 259 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 A8MUI8 341 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 CLDN25C9JDP6 229 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 IRF6O14896 467 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 ADSSP30520 456 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 GTF2H1P32780 548 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 ACTR2P61160 394 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 KLRC3Q07444 240 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 GALNTL6Q49A17 601 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 DPH6Q7L8W6 267 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 AMER2Q8N7J2 671 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 RORBQ92753 470 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 GLMNQ92990 594 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 CHID1Q9BWS9 393 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 STK39Q9UEW8 545 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.65□□□□□ -1.35
PCNX1-207ENST00000554691 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.65□□□□□ -1.35
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