RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ITPKCQ96DU7 683 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RNF14Q9UBS8 474 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 COG5Q9UP83 839 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SORBS3O60504 671 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RASSF9O75901 435 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G4BP0C869 781 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PYGMP11217 842 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NLRP12P59046 1061 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 BNC1Q01954 994 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PDCLQ13371 301 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DMC1Q14565 340 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PADI6Q6TGC4 694 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 METTL6Q8TCB7 284 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM15Q9C019 465 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SELENONQ9NZV5 590 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PQ27 194 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PQ64 194 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PQD8 194 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MEI4A8MW99 385 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 WNT10BO00744 389 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CRYZL1O95825 349 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 IRAK1P51617 712 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PGDP52209 483 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GUCY1A3Q02108 690 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 USP38Q8NB14 1042 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SP140LQ9H930 580 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NEK6Q9HC98 313 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RRN3Q9NYV6 651 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 H3BRJ5 948 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KRT37O76014 449 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FGF19O95750 216 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HLA-DRAP01903 254 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SSTP61278 116 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ERVK-9P63128 1117 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ERVK-24P63145 666 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ANKS6Q68DC2 871 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 APBB2Q92870 758 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SNX27Q96L92 541 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HPS4Q9NQG7 708 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FGBP02675 491 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ITGALP20701 1170 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FPGSQ05932 587 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC63Q05C16 580 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 LRMPQ12912 555 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 EFR3AQ14156 821 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GNA13Q14344 377 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.55□□□□□ -1.36
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