RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 KRT82Q9NSB4 513 aa23.22■■□□□ 1.31
PUS1-211ENST00000544662 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.22■■□□□ 1.31
PUS1-211ENST00000544662 COL4A2P08572 1712 aa23.22■■□□□ 1.31
PUS1-211ENST00000544662 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa23.21■■□□□ 1.31
PUS1-211ENST00000544662 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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PUS1-211ENST00000544662 FCHO2Q0JRZ9 810 aa23.21■■□□□ 1.31
PUS1-211ENST00000544662 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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PUS1-211ENST00000544662 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.21■■□□□ 1.31
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PUS1-211ENST00000544662 AP1G2O75843 785 aa23.2■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 GNA14O95837 355 aa23.2■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 PRSS33Q8NF86 280 aa23.2■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 TRIM59Q8IWR1 403 aa23.19■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 NUP93Q8N1F7 819 aa23.19■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 TTC39CQ8N584 583 aa23.19■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 MLKLQ8NB16 471 aa23.19■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 MED15Q96RN5 788 aa23.19■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 CYP2S1Q96SQ9 504 aa23.19■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 CISHQ9NSE2 258 aa23.19■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 CCL26Q9Y258 94 aa23.19■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 C2orf78A6NCI8 922 aa23.18■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 ARNTLO00327 626 aa23.18■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 LRMPQ12912 555 aa23.18■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.18■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 ZNF394Q53GI3 561 aa23.18■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 ZMIZ2Q8NF64 920 aa23.18■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.18■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 SLC22A12Q96S37 553 aa23.18■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 TDP1Q9NUW8 608 aa23.18■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 GCNT4Q9P109 453 aa23.18■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 SIT1Q9Y3P8 196 aa23.18■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 BEST1O76090 585 aa23.17■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 USP17L7P0C7H9 530 aa23.17■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 CD72P21854 359 aa23.17■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 YWHAQP27348 245 aa23.17■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 CUL2Q13617 745 aa23.17■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 ZFYVE19Q96K21 471 aa23.17■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 KIF9Q9HAQ2 790 aa23.17■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 ZNF840PA6NDX5 716 aa23.16■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 FAM200BP0CF97 657 aa23.16■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23.16■■□□□ 1.3
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PUS1-211ENST00000544662 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa23.16■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.16■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 SHISA7A6NL88 538 aa23.15■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 P4HA2O15460 535 aa23.15■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 DCNP07585 359 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 HDCP19113 662 aa23.15■■□□□ 1.3
PUS1-211ENST00000544662 PLCB2Q00722 1185 aa23.15■■□□□ 1.3
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