RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 TP73O15350 636 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 MAGEB3O15480 346 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 PIGNO95427 931 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 EGFRP00533 1210 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 PGRP06401 933 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 CHN1P15882 459 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 FGFR2P21802 821 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 SP100P23497 879 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 HLA-FP30511 346 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 SLC26A3P40879 764 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 STX17P56962 302 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 GNGT1P63211 74 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 RELAQ04206 551 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 AMHR2Q16671 573 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 FAM228AQ86W67 206 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 LONP2Q86WA8 852 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 METTL6Q8TCB7 284 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 PTPRN2Q92932 1015 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 OMA1Q96E52 524 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 CDRT15Q96T59 188 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 ARMT1Q9H993 441 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 RASSF1Q9NS23 344 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 A0A1B0GVL5 298 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 NPR1P16066 1061 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 GJB2P29033 226 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 SLC9A3P48764 834 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 GTF2A2P52657 109 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 RNF4P78317 190 aa6.45□□□□□ -1.38
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LMO3-225ENST00000541295 CUL4AQ13619 759 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 GALNT3Q14435 633 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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LMO3-225ENST00000541295 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 FAM209BQ5JX69 171 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 ITIH5Q86UX2 942 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 LZTR1Q8N653 840 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 ZNF566Q969W8 418 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 VPS51Q9UID3 782 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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LMO3-225ENST00000541295 COL4A1P02462 1669 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 CTSHP09668 335 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 GSSP48637 474 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 RGS7P49802 495 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 RAP1GDS1P52306 607 aa6.44□□□□□ -1.38
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LMO3-225ENST00000541295 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 SMU1Q2TAY7 513 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 C12orf60Q5U649 245 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 KANK2Q63ZY3 851 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 XKR5Q6UX68 686 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 TMEM237Q96Q45 408 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 WACQ9BTA9 647 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 ABCG8Q9H221 673 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-225ENST00000541295 MARCH7Q9H992 704 aa6.44□□□□□ -1.38
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