RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	LSAMP	Q13449	338 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	MBLAC2	Q68D91	279 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	NSMF	Q6X4W1	530 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	TLK2	Q86UE8	772 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	AHI1	Q8N157	1196 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	UBR7	Q8N806	425 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PJA1	Q8NG27	643 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ATL2	Q8NHH9	583 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	MDM1	Q8TC05	714 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	C12orf42	Q96LP6	360 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	MYL10	Q9BUA6	226 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	WNT16	Q9UBV4	365 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SPG11	Q96JI7	2443 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ATM	Q13315	3056 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ZAR1L	A6NP61	321 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CAPN9	O14815	690 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	IKBKB	O14920	756 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PRODH	O43272	600 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SLC28A2	O43868	658 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	NPTXR	O95502	500 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ITGB1	P05556	798 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CSRP3	P50461	194 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	RRAD	P55042	308 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	TNFAIP2	Q03169	654 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	INF2	Q27J81	1249 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CERS3	Q8IU89	383 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	STPG3	Q8N7X2	389 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	BVES	Q8NE79	360 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	HAS1	Q92839	578 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	TOP1MT	Q969P6	601 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	OSBP2	Q969R2	916 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	C8orf48	Q96LL4	319 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CAPN8	A6NHC0	703 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007		F5H6K3	240 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	ALDH1L1	O75891	902 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	IGKV5-2	P06315	115 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CSF1R	P07333	972 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	MMP3	P08254	477 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	MYL3	P08590	195 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CEACAM1	P13688	526 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	MCAM	P43121	646 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	GUCY2F	P51841	1108 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	EPHB1	P54762	984 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	FOXL1	Q12952	345 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	KCNC3	Q14003	757 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	LY6D	Q14210	128 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	COG2	Q14746	738 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	GRM7	Q14831	915 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	PTGIS	Q16647	500 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	DUSP6	Q16828	381 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	RNF151	Q2KHN1	245 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	CES5A	Q6NT32	575 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRPL48-208	ENST00000537007	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		3.16	□□□□□ -1.9

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