RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	ICA1	Q05084	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MUL1	Q969V5	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SMO	Q99835	787 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	BTAF1	O14981	1849 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	COL18A1	P39060	1754 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PIK3C2A	O00443	1686 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	USP6	P35125	1406 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ACE	P12821	1306 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	FFAR2	O15552	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	GC	P02774	474 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CKB	P12277	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MYL4	P12829	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64	4e-12	■□□□□ 9.3
MDM2-223	ENST00000536089	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	KLRC1	P26715	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CHKA	P35790	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	HSPA7	P48741	367 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SLC11A2	P49281	568 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PIGF	Q07326	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	FOXL1	Q12952	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MAML1	Q92585	1016 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RGPD5	Q99666	1765 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089		A0A087WV62	115 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1W2PPC4	97 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TRIM13	O60858	407 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RAD17	O75943	681 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	DNAJB5	O75953	348 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ADRB1	P08588	477 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	C1QTNF8	P60827	252 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	KRT17	Q04695	432 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	BLMH	Q13867	455 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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