RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534617.5

BRMS1-209, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 905 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-209ENST00000534617 ENPEPQ07075 957 aa14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 TNK2Q07912 1038 aa14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 SPATA20Q8TB22 786 aa14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 MSANTD3Q96H12 275 aa14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 SLC22A12Q96S37 553 aa14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 KRT82Q9NSB4 513 aa14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 EHD2Q9NZN4 543 aa14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.92□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 SOBPA7XYQ1 873 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 LAMTOR5O43504 91 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 GFRA3O60609 400 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 CTHP32929 405 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 STIM1Q13586 685 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 KRT39Q6A163 491 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 ADSSL1Q8N142 457 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 RIN3Q8TB24 985 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 CLDN23Q96B33 292 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 GKN1Q9NS71 199 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.91□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 PSMA7O14818 248 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 STX10O60499 249 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 AP1G2O75843 785 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 ABL1P00519 1130 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 CD58P19256 250 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 GTF2H1P32780 548 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 LRRC63Q05C16 580 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 USP4Q13107 963 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 MTF1Q14872 753 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF77Q15935 545 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 UNC93AQ86WB7 457 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 FUKQ8N0W3 1084 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 KCNK16Q96T55 309 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 EBF3Q9H4W6 596 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 GCNT4Q9P109 453 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 R4GN57 208 aa14.9□□□□□ -0.02
BRMS1-209ENST00000534617 PROB1E7EW31 1015 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 BIN1O00499 593 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 SP9P0CG40 484 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 ARSAP15289 507 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 HDCP19113 662 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 YWHAQP27348 245 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 ADORA2BP29275 332 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 PDE6CP51160 858 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 SLC5A3P53794 718 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 INCA1Q0VD86 236 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 TAF10Q12962 218 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 MTAPQ13126 283 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 FZD5Q13467 585 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 NUP93Q8N1F7 819 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 C12orf29Q8N999 325 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 FBXO32Q969P5 355 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 TWNKQ96RR1 684 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 CHRDQ9H2X0 955 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 HPS4Q9NQG7 708 aa14.89□□□□□ -0.03
BRMS1-209ENST00000534617 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms