RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 SMOQ99835 787 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 KXD1Q9BQD3 176 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 NDST4Q9H3R1 872 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 TASP1Q9H6P5 420 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 COL4A2P08572 1712 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ECI2O75521 394 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 BEST1O76090 585 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 RRAGAQ7L523 313 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 NUP93Q8N1F7 819 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 FANCLQ9NW38 375 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 SOBPA7XYQ1 873 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC9A1P19634 815 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP3K7CLP57077 242 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 ANO6Q4KMQ2 910 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM270Q6UE05 265 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TNFRSF10BO14763 440 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 PAEPP09466 180 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SRFP11831 508 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 NPR3P17342 541 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 PON1P27169 355 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 WEE1P30291 646 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC5A3P53794 718 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 NCAPHQ15003 741 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SGO2Q562F6 1265 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM81BQ96LP2 452 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 DUSP16Q9BY84 665 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 NCANO14594 1321 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SYCE3A1L190 88 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR37L1O60883 481 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 VDRP11473 427 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 YWHAQP27348 245 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT31Q15323 416 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TXNDC8Q6A555 127 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 VITQ6UXI7 678 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 MON1AQ86VX9 555 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 E2F7Q96AV8 911 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 ASIC4Q96FT7 647 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SIX2Q9NPC8 291 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 COMMD8Q9NX08 183 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 IL37Q9NZH6 218 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 KMT2EQ8IZD2 1858 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 HHLA1C9JL84 531 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 CD19P15391 556 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 VIPR2P41587 438 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP3CCP48454 512 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF132P52740 706 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 MFAP3P55082 362 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TAF10Q12962 218 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 GJB7Q6PEY0 223 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXO32Q969P5 355 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.11■□□□□ 0.81
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