RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 C2orf42Q9NWW7 574 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 HMGXB4Q9UGU5 601 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM66O15016 1216 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 MAPK13O15264 365 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 HLA-DRAP01903 254 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ANXA13P27216 316 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 VAMP7P51809 220 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 NOP14P78316 857 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ZXDBP98169 803 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 SATB1Q01826 763 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP3CAQ08209 521 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 USP4Q13107 963 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ORC1Q13415 861 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 MAMSTRQ6ZN01 415 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ZBTB44Q8NCP5 570 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ENGASEQ8NFI3 743 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 CEP295NLQ96MC4 621 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ELOVL4Q9GZR5 314 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF292O60281 2723 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 IKBKBO14920 756 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 CLSTN1O94985 981 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF20AO95235 890 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ASS1P00966 412 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 CKMP06732 381 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ASPAP45381 313 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 RUNX3Q13761 415 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 CCINQ13939 588 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 MTF1Q14872 753 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 C1orf228Q6PIY5 440 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 SUMF1Q8NBK3 374 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 OBSL1O75147 1896 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF840PA6NDX5 716 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 USP17L7P0C7H9 530 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 HOXC13P31276 330 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 GCLMP48507 274 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ACOT1Q86TX2 421 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM35AQ86V20 835 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM186BQ8IYM0 893 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 TTC16Q8NEE8 873 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 TAS1R2Q8TE23 839 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 SH3RF2Q8TEC5 729 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNK16Q96T55 309 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 IER2Q9BTL4 223 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ZSCAN32Q9NX65 697 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 WNT6Q9Y6F9 365 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 LILRB5O75023 590 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 HDCP19113 662 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 PIK3CAP42336 1068 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 NUCB2P80303 420 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 TAF10Q12962 218 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 FUKQ8N0W3 1084 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 DENND4CQ5VZ89 1909 aa25.45■■□□□ 1.67
PACSIN3-204ENST00000528201 KINO60870 393 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 NDST1P52848 882 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 ADAM9Q13443 819 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC32Q14392 662 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 FSTL4Q6MZW2 842 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 TAF4BQ92750 862 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF38Q9H0F5 515 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 PTPRDP23468 1912 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC130P13994 396 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 CCR3P51677 355 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 DMWDQ09019 674 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 PDGFRLQ15198 375 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 PKN3Q6P5Z2 889 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 SPEM1Q8N4L4 309 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 OSCP1Q8WVF1 389 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 TNIP3Q96KP6 325 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 TWNKQ96RR1 684 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 FANCMQ8IYD8 2048 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 TNFRSF10BO14763 440 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 BEST1O76090 585 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 OLFM2O95897 454 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 TCF3P15923 654 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 PRCPP42785 496 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 CXCL12P48061 93 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 EML3Q32P44 896 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-204ENST00000528201 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.43■■□□□ 1.66
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