RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525506.1

RBBP4-216, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 2

Gene RBBP4, Length 501 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-216	ENST00000525506	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	CYP27A1	Q02318	531 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	PPP3CA	Q08209	521 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	PAK1	Q13153	545 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	KRT39	Q6A163	491 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	VSTM1	Q6UX27	236 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	TTC39C	Q8N584	583 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	SLC22A12	Q96S37	553 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	FRYL	O94915	3013 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-216	ENST00000525506	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	NOL4	O94818	638 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	CHRNB1	P11230	501 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	MXI1	P50539	228 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	CDH8	P55286	799 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	GAS6	Q14393	721 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	PON2	Q15165	354 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	UNC93A	Q86WB7	457 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	MLKL	Q8NB16	471 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	NELFB	Q8WX92	580 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	TNIP3	Q96KP6	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	SNX25	Q9H3E2	840 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	OBP2A	Q9NY56	170 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	C2orf78	A6NCI8	922 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	CLDN5	O00501	218 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	P4HA2	O15460	535 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	CLSTN1	O94985	981 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	HLA-DRA	P01903	254 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	ARSA	P15289	507 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	WEE1	P30291	646 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	HOXC13	P31276	330 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	CTH	P32929	405 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	AVPR1A	P37288	418 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	GRIK1	P39086	918 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	MAGEA9	P43362	315 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	ASPA	P45381	313 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	GCLM	P48507	274 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	CACNA2D1	P54289	1103 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	USP46	P62068	366 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	INCA1	Q0VD86	236 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506		Q6ZS52	159 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	MON1A	Q86VX9	555 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	SLC35C1	Q96A29	364 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	PCED1B	Q96HM7	432 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	SPATA17	Q96L03	361 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	MYRFL	Q96LU7	910 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-216	ENST00000525506	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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