RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	TGM5	O43548	720 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	APOL3	O95236	402 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	CYP17A1	P05093	508 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	HSD3B1	P14060	373 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	GPR3	P46089	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	SCAND1	P57086	179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	OCRL	Q01968	901 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	ACAP2	Q15057	778 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	BROX	Q5VW32	411 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	NME9	Q86XW9	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	NELL2	Q99435	816 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	DAPK1	P53355	1430 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356		B5MCH6	92 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	EYA2	O00167	538 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	TUSC2	O75896	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	MBD4	O95243	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	CD4	P01730	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	PYGL	P06737	847 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	ABCB4	P21439	1286 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	CHN2	P52757	468 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	FAM193A	P78312	1265 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	ZBED6	P86452	979 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	APBA1	Q02410	837 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	NUCB1	Q02818	461 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	CLUL1	Q15846	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	JADE3	Q92613	823 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	PXDN	Q92626	1479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	ORC4	O43929	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	PPM1A	P35813	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	PRIM2	P49643	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	MPP1	Q00013	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	TIMP4	Q99727	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	STK26	Q9P289	416 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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