RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	APBA1	Q02410	837 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXO1	Q12778	655 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SNX22	Q96L94	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM24	O15164	1050 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX33	O43247	280 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TIPRL	O75663	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	NDST3	O95803	873 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	AHSG	P02765	367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CD1A	P06126	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SBK3	P0C264	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TRPC3	Q13507	836 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68	3e-6	■■□□□ 12.1
FAM49B-222	ENST00000522702	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	AREL1	O15033	823 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PJA2	O43164	708 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ASNA1	O43681	348 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MT-ND5	P03915	603 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	VDR	P11473	427 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC6A4	P31645	630 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	RAD52	P43351	418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TUB	P50607	506 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SOX8	P57073	446 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB30	Q15771	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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