RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516637.1

RNU6-405P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 405, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-405P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-405P-201ENST00000516637 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 IZUMO1Q8IYV9 350 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 MPP5Q8N3R9 675 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZBTB34Q8NCN2 500 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 OR6B3Q8NGW1 331 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 TMEM171Q8WVE6 324 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 RITA1Q96K30 269 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 C5orf34Q96MH7 638 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 ASB2Q96Q27 587 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 CDH19Q9H159 772 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 BHMT2Q9H2M3 363 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 ANLNQ9NQW6 1124 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-405P-201ENST00000516637 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 TMEM233B4DJY2 109 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 H7C1Q1 480 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 AP4M1O00189 453 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 DLDP09622 509 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 FPR3P25089 353 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 PRKAG1P54619 331 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 IGBP1P78318 339 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 SLC13A2Q13183 592 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 GTF2H3Q13889 308 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 CYP1B1Q16678 543 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 PLA1AQ53H76 456 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 SLC9A4Q6AI14 798 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 TERB1Q8NA31 727 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 C8orf58Q8NAV2 365 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 DPH1Q9BZG8 443 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 PDGFCQ9NRA1 345 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 TBC1D4O60343 1298 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 RFPL1O75677 317 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 PRKCBP05771 671 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 PTGER1P34995 402 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 ARHGAP25P42331 645 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 RENBPP51606 427 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 E2F1Q01094 437 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 PTCHD3Q3KNS1 767 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 MTHFD1LQ6UB35 978 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 NPNTQ6UXI9 565 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 GALNT16Q8N428 558 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF366Q8N895 744 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 MAML1Q92585 1016 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 PPP2R3CQ969Q6 453 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 SNX18Q96RF0 628 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 CAMKK2Q96RR4 588 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 PRR25Q96S07 402 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 B3GNT5Q9BYG0 378 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 CIPCQ9C0C6 399 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 KCNU1A8MYU2 1149 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 TUSC2O75896 110 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 EPHB1P54762 984 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 RAB32Q13637 225 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 CNGA4Q8IV77 575 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 GALNT4Q8N4A0 578 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 IL31RAQ8NI17 732 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 DENND1AQ8TEH3 1009 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 C17orf80Q9BSJ5 609 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 WDR17Q8IZU2 1322 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF521Q96K83 1311 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 TBX3O15119 743 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 MOSPD3O75425 235 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 SLC7A1P30825 629 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 PSG6Q00889 435 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 MLC1Q15049 377 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-405P-201ENST00000516637 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms