RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ICAM1	P05362	532 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ITGAV	P06756	1048 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RARB	P10826	455 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT5	P13647	590 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TCF4	P15884	667 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CD58	P19256	250 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GLRA2	P23416	452 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ADRA1D	P25100	572 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CNGA1	P29973	690 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	VHL	P40337	213 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CDKN2B	P42772	138 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RASSF2	P50749	326 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ARSE	P51690	589 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RAP1GDS1	P52306	607 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PEX3	P56589	373 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RTP1	P59025	263 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PTS	Q03393	145 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ADCY1	Q08828	1119 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GPS1	Q13098	491 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DLGAP5	Q15398	846 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZACN	Q401N2	412 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	HHAT	Q5VTY9	493 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF787	Q6DD87	383 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RDM1	Q8NG50	284 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NRG4	Q8WWG1	115 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NGLY1	Q96IV0	654 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SMC6	Q96SB8	1091 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SH3GL3	Q99963	347 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	VPS11	Q9H270	941 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNK13	Q9HB14	408 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FEM1B	Q9UK73	627 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPRJ	Q12913	1337 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CNTNAP1	P78357	1384 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KLHL33	A6NCF5	533 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CAPN14	A8MX76	684 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR64	B1ANS9	1081 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TM9SF1	O15321	606 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GSC2	O15499	205 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	EXTL3	O43909	919 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF862	O60290	1169 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT36	O76013	467 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TJP3	O95049	919 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58

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