RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 BUB1O43683 1085 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 LCA5LO95447 670 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ASMTLO95671 621 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 MYL6BP14649 208 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PRKACAP17612 351 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 HMOX2P30519 316 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GBP1P32455 592 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 MSH2P43246 934 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 SCNN1GP51170 649 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 RAB14P61106 215 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TSPAN5P62079 268 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 NKX3-2P78367 333 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 KLC1Q07866 573 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNAB2Q13303 367 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 UBE3CQ15386 1083 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TSC22D1Q15714 1073 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PCSK7Q16549 785 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 C2orf27AQ580R0 203 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CDH24Q86UP0 819 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 HID1Q8IV36 788 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ATAD1Q8NBU5 361 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ACPTQ9BZG2 426 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 NDEL1Q9GZM8 345 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 IL19Q9UHD0 177 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAF5O00463 557 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PDE8AO60658 829 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 SEC22BO75396 215 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ABLIM3O94929 683 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 EGFRP00533 1210 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 HRGP04196 525 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ALDH2P05091 517 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GNAT1P11488 350 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CPA3P15088 417 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 VCLP18206 1134 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ALAS2P22557 587 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 RGS7P49802 495 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 HNMTP50135 292 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 LGALS3BPQ08380 585 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 MEA1Q16626 185 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 AAK1Q2M2I8 961 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GPR158Q5T848 1215 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GRTP1Q5TC63 336 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM122CQ6P4D5 195 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF365Q70YC5 407 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 NLRP8Q86W28 1048 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM71DQ8N9W8 422 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 RIN3Q8TB24 985 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CRELD1Q96HD1 420 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 EXOC2Q96KP1 924 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CFAP57Q96MR6 1250 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 WDR24Q96S15 920 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 UBXN6Q9BZV1 441 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TPK1Q9H3S4 243 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNK13Q9HB14 408 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 LY9Q9HBG7 655 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 HCN2Q9UL51 889 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A087WZG4 1122 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC78A2IDD5 438 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 EYA2O00167 538 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ZSCAN12O43309 604 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PRPSAP2O60256 369 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CAMTA2O94983 1202 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 KRT7P08729 469 aa9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms