RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-208ENST00000493607 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 CD72P21854 359 aa24.79■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 STIM1Q13586 685 aa24.79■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 KIAA1958Q8N8K9 716 aa24.79■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 CCDC150Q8NCX0 1101 aa24.79■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 TAS1R2Q8TE23 839 aa24.79■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 FAM83CQ9BQN1 747 aa24.79■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.79■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 COMMD8Q9NX08 183 aa24.79■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 GCNT4Q9P109 453 aa24.79■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 PSMA7O14818 248 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 LRRN2O75325 713 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 CCNE1P24864 410 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 RAP1GAPP47736 663 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 ANKRD40Q6AI12 368 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 PAQR9Q6ZVX9 377 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 TTC39CQ8N584 583 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 OVCA2Q8WZ82 227 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 SMARCD1Q96GM5 515 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 PHOX2BQ99453 314 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 NIF3L1Q9GZT8 377 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 TMEM30AQ9NV96 361 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 FBXO4Q9UKT5 387 aa24.78■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 MXI1P50539 228 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 NDST1P52848 882 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 USP46P62068 366 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 ZNF528Q3MIS6 628 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 SPOPLQ6IQ16 392 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 FAM35AQ86V20 835 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 FUKQ8N0W3 1084 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 NUP93Q8N1F7 819 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 DNAI2Q9GZS0 605 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 SEMA4AQ9H3S1 761 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 FAM86C1Q9NVL1 165 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 IL37Q9NZH6 218 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 MAN1B1Q9UKM7 699 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 CCL26Q9Y258 94 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 COQ4Q9Y3A0 265 aa24.77■■□□□ 1.56
SERBP1-208ENST00000493607 CLSTN1O94985 981 aa24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 OLFM2O95897 454 aa24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 CACNA2D1P54289 1103 aa24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 FBXL13Q8NEE6 735 aa24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 PDZD8Q8NEN9 1154 aa24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 CHRDQ9H2X0 955 aa24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa24.76■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 FAM92AA1XBS5 289 aa24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 ZNF840PA6NDX5 716 aa24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 CLDN5O00501 218 aa24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 CTHP32929 405 aa24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 PMS1P54277 932 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 USP4Q13107 963 aa24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 PDGFRLQ15198 375 aa24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 ZNF77Q15935 545 aa24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 ACOT1Q86TX2 421 aa24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 CEP63Q96MT8 703 aa24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 GKN1Q9NS71 199 aa24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 RAB20Q9NX57 234 aa24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 GTSE1Q9NYZ3 720 aa24.75■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 TNFRSF10BO14763 440 aa24.74■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 CKMP06732 381 aa24.74■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 CHRNB1P11230 501 aa24.74■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 HDCP19113 662 aa24.74■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 UBE2HP62256 183 aa24.74■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 MORC3Q14149 939 aa24.74■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 SNX30Q5VWJ9 437 aa24.74■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 ELMO3Q96BJ8 720 aa24.74■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 ZFYVE19Q96K21 471 aa24.74■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 SLC22A12Q96S37 553 aa24.74■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.74■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 MYO15AQ9UKN7 3530 aa24.73■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 C2orf78A6NCI8 922 aa24.73■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 PMM2O15305 246 aa24.73■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 LAMTOR5O43504 91 aa24.73■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 CILPO75339 1184 aa24.73■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 SP9P0CG40 484 aa24.73■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 YWHAQP27348 245 aa24.73■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 SLC7A9P82251 487 aa24.73■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 TAF10Q12962 218 aa24.73■■□□□ 1.55
SERBP1-208ENST00000493607 RUNX3Q13761 415 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms