RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-208ENST00000490163 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 TSPAN33Q86UF1 283 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 TRABD2AQ86V40 505 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 LILRA2Q8N149 483 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ZNF480Q8WV37 535 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 SCAMP4Q969E2 229 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ALG14Q96F25 216 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 MEGF10Q96KG7 1140 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 UIMC1Q96RL1 719 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 DBNDD2Q9BQY9 259 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 POFUT1Q9H488 388 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 DBNDD1Q9H9R9 158 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 PLB1Q6P1J6 1458 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 NEURL4Q96JN8 1562 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 AQP12BA6NM10 295 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 E7ENX8 843 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 TUBB4AP04350 444 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 CEACAM5P06731 702 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 IDEP14735 1019 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 IL10P22301 178 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 PIK3CGP48736 1102 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 IL13RA1P78552 427 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 TAP2Q03519 686 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 MTAPQ13126 283 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 RAB41Q5JT25 222 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 GLB1L2Q8IW92 636 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 OXR1Q8N573 874 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 FAM162AQ96A26 154 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ZSWIM3Q96MP5 696 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 SLC2A13Q96QE2 648 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 HIST1H2AJQ99878 128 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 MAGEB5Q9BZ81 275 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ABI3Q9P2A4 366 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 IFT172Q9UG01 1749 aa3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 FRMD3A2A2Y4 597 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 GLOD5A6NK44 160 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ITGA2BP08514 1039 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ARP10275 920 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 KRT9P35527 623 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 PIK3CAP42336 1068 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 PXNP49023 591 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 KHKP50053 298 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 PTTG1IPP53801 180 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 PRKAA2P54646 552 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 CAMK1Q14012 370 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 DENND1BQ6P3S1 775 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 FDX2Q6P4F2 183 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 IRF2BP1Q8IU81 584 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ALPK1Q96QP1 1244 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 AGAP2Q99490 1192 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ANAPC2Q9UJX6 822 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ABCA6Q8N139 1617 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 C17orf100A8MU93 164 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 SEC22BO75396 215 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 GOSR1O95249 250 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 KNG1P01042 644 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 CYBBP04839 570 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ATP6V1B1P15313 513 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ABCD3P28288 659 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 CHRNEQ04844 493 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 TAF5Q15542 800 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 PAOXQ6QHF9 649 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 USP49Q70CQ1 688 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 VSIG1Q86XK7 387 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 SCML4Q8N228 414 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 CARNMT1Q8N4J0 409 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 AFAP1Q8N556 730 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 ATG16L2Q8NAA4 619 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 DPF2Q92785 391 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 CFAP57Q96MR6 1250 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.29□□□□□ -1.88
UBXN4-208ENST00000490163 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms