RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	MYLPF	Q96A32	169 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	DACH1	Q9UI36	760 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP8B3	O60423	1300 aa		18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP2C2	O75185	946 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	BDNF	P23560	247 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNE1	P24864	410 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CTH	P32929	405 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIK1	P39086	918 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CCR3	P51677	355 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SV2A	Q7L0J3	742 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	GCNT4	Q9P109	453 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	PATJ	Q8NI35	1801 aa		18.39	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TADA3	O75528	432 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	VNN1	O95497	513 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXA6	P31267	233 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR15	P49685	360 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	VAMP7	P51809	220 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	RUNX3	Q13761	415 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNDC8	Q6A555	127 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC39C	Q8N584	583 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	MLKL	Q8NB16	471 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	GPT2	Q8TD30	523 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	GKN1	Q9NS71	199 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	IL37	Q9NZH6	218 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	DMD	P11532	3685 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	STX10	O60499	249 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	LILRB5	O75023	590 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CASP4	P49662	377 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP27A1	Q02318	531 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	MTAP	Q13126	283 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	NELFB	Q8WX92	580 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		18.37	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424		F8VP50	259 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	HCRT	O43612	131 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	AKAP3	O75969	853 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	OLFM2	O95897	454 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	COL4A2	P08572	1712 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	HDC	P19113	662 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC7A9	P82251	487 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	USP4	Q13107	963 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	PAK1	Q13153	545 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CCIN	Q13939	588 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF77	Q15935	545 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP93	Q8N1F7	819 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	NME7	Q9Y5B8	376 aa		18.36	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM92A	A1XBS5	289 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		18.35	■□□□□ 0.53

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