RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	GALC	P54803	685 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	INHBE	P58166	350 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	DRP2	Q13474	957 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TFDP1	Q14186	410 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MAPK6	Q16659	721 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	KYAT1	Q16773	422 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CST9	Q5W186	159 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR49	Q8IV35	697 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GLG1	Q92896	1179 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ISL2	Q96A47	359 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SAAL1	Q96ER3	474 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	BICD1	Q96G01	975 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF112	Q9ULX5	631 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247		Q9Y3F1	56 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM170B	A6NMN3	283 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CLDN3	O15551	220 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RTN2	O75298	545 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PALM	O75781	387 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	VNN1	O95497	513 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	BPNT1	O95861	308 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-DRA	P01903	254 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP1A2	P05177	515 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PRKCB	P05771	671 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	INSRR	P14616	1297 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP11B1	P15538	503 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MCM3	P25205	808 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFRSF8	P28908	595 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	HOXC8	P31273	242 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SOX9	P48436	509 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	BPIFB4	P59827	614 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NKX3-2	P78367	333 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC42EP1	Q00587	391 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FMO1	Q01740	532 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CDR2	Q01850	454 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RING1	Q06587	406 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CDK5R2	Q13319	367 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ACVR2B	Q13705	512 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MPP2	Q14168	576 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MAP7	Q14244	749 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	C17orf99	Q6UX52	265 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF410	Q86VK4	478 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TAF4B	Q92750	862 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	COPS5	Q92905	334 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	HES6	Q96HZ4	224 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PBK	Q96KB5	322 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FNBP1	Q96RU3	617 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MMS19	Q96T76	1030 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	5.93	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		5.93	□□□□□ -1.46

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