RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	CEP78	Q5JTW2	689 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	NPNT	Q6UXI9	565 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	GPR142	Q7Z601	462 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	ERO1B	Q86YB8	467 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	AHI1	Q8N157	1196 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	RNF152	Q8N8N0	203 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	GPR152	Q8TDT2	470 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	HES6	Q96HZ4	224 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	FAM84A	Q96KN4	292 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	IFT74	Q96LB3	600 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	SPX	Q9BT56	116 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	USP44	Q9H0E7	712 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	KCND1	Q9NSA2	647 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	EHD2	Q9NZN4	543 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	FEM1B	Q9UK73	627 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	TLK1	Q9UKI8	766 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	STX8	Q9UNK0	236 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	XKRY2	A2RUG3	117 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	URAD	A6NGE7	173 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	TARM1	B6A8C7	271 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398		H0YCG3	227 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	TRAF5	O00463	557 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	CXCL11	O14625	94 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	SCAMP1	O15126	338 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	SULT1B1	O43704	296 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	KRT86	O43790	486 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	FTCD	O95954	541 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	TPO	P07202	933 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	QDPR	P09417	244 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	CSF1	P09603	554 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	PRG2	P13727	222 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	PDC	P20941	246 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	CHM	P24386	653 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	RPA1	P27694	616 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	KRT2	P35908	639 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	CETN2	P41208	172 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	RGS2	P41220	211 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	ALDH9A1	P49189	494 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	HUNK	P57058	714 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	PMP22	Q01453	160 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	DSG1	Q02413	1049 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	MAPK7	Q13164	816 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	HERC3	Q15034	1050 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	GRTP1	Q5TC63	336 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	RNF220	Q5VTB9	566 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	NOTUM	Q6P988	496 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	BEND4	Q6ZU67	534 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	ARMCX2	Q7L311	632 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	TLK2	Q86UE8	772 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTC3-214	ENST00000472398	OR8K3	Q8NH51	312 aa		3.41	□□□□□ -1.86

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