RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	BMP5	P22003	454 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	PRDX5	P30044	214 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	GUCY1A2	P33402	732 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	PTPN7	P35236	360 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	LIFR	P42702	1097 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	CHN2	P52757	468 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	SOX8	P57073	446 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	CLRN1	P58418	232 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	TAP1	Q03518	808 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	SP140	Q13342	867 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	RAB30	Q15771	203 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	EMC10	Q5UCC4	262 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	PDXDC1	Q6P996	788 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	RNF44	Q7L0R7	432 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	KRT77	Q7Z794	578 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	MAML1	Q92585	1016 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	RUBCN	Q92622	972 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	STK31	Q9BXU1	1019 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	POGK	Q9P215	609 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	MED16	Q9Y2X0	877 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CNOT10-208	ENST00000463006	TISP43	B9A030	160 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006		B9A039	149 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	TBC1D4	O60343	1298 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	GPR32	O75388	356 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	TBX18	O95935	607 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	AHSG	P02765	367 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	ITGA5	P08648	1049 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	TGM1	P22735	817 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	KCNJ5	P48544	419 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	PIK3CG	P48736	1102 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	TLE2	Q04725	743 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC13A2	Q13183	592 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	RAB32	Q13637	225 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	LIN54	Q6MZP7	749 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	BRINP3	Q76B58	766 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	OR8H2	Q8N162	312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	STYX	Q8WUJ0	223 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	LRRC46	Q96FV0	321 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	LANCL2	Q9NS86	450 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	PIPSL	A2A3N6	862 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	UNC119B	A6NIH7	251 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	F2RL2	O00254	374 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	BTN3A1	O00481	513 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	ORC4	O43929	436 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	GFPT2	O94808	682 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	SPDEF	O95238	335 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	TNFRSF6B	O95407	300 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	NDST3	O95803	873 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	CFI	P05156	583 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	ELANE	P08246	267 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	SPATA31D3	P0C874	917 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	DDC	P20711	480 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	RPS6KB1	P23443	525 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	MCC	P23508	829 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CNOT10-208	ENST00000463006	SCAP	Q12770	1279 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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