RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM240Q5SV17 173 aa22.04■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 TRNP1Q6NT89 227 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM171BQ6P995 826 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 ALG3Q92685 438 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.04■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 F8VP50 259 aa22.03■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 MYO7AQ13402 2215 aa22.03■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 HES6Q96HZ4 224 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 YME1L1Q96TA2 773 aa22.03■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.02■■□□□ 1.12
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SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 SCINQ9Y6U3 715 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPRDP23468 1912 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 SPOPO43791 374 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM200BP0CF97 657 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 ADIGQ0VDE8 80 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.113e-6■■□□□ 12
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.01■■□□□ 1.11
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SH3BP2-204ENST00000452765 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.115e-6■■■■■ 163.2
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SH3BP2-204ENST00000452765 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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SH3BP2-204ENST00000452765 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 CD101Q93033 1021 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 BAIAP3O94812 1187 aa21.99■■□□□ 1.11
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SH3BP2-204ENST00000452765 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.99■■□□□ 1.11
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SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.99■■□□□ 1.11
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SH3BP2-204ENST00000452765 CSPG5O95196 566 aa21.99■■□□□ 1.11
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SH3BP2-204ENST00000452765 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.99■■□□□ 1.11
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SH3BP2-204ENST00000452765 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 HHLA1C9JL84 531 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 GJB5O95377 273 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC6A3Q01959 620 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 GPR152Q8TDT2 470 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 STK32AQ8WU08 396 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-204ENST00000452765 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.98■■□□□ 1.11
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