RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 VPS16Q9H269 839 aa13.3□□□□□ -0.28
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PRAME-208ENST00000438888 C2orf42Q9NWW7 574 aa13.3□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 ASB3Q9Y575 518 aa13.3□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
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PRAME-208ENST00000438888 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
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PRAME-208ENST00000438888 IL21Q9HBE4 155 aa13.28□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 PDE11AQ9HCR9 933 aa13.28□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
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PRAME-208ENST00000438888 KPNA7A9QM74 516 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 RETP07949 1114 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 TNNI1P19237 187 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 PAX3P23760 479 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 AVPR1AP37288 418 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-208ENST00000438888 GCLMP48507 274 aa13.26□□□□□ -0.29
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