RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	ABLIM1	O14639	778 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPFIA2	O75334	1257 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	OFD1	O75665	1012 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	DGKI	O75912	1065 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	IL18RAP	O95256	599 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	GJB5	O95377	273 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	GNA14	O95837	355 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	TH	P07101	528 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	CXCL8	P10145	99 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	BMP6	P22004	513 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADSS	P30520	456 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	HOXD13	P35453	343 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	GNAL	P38405	381 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	TNFSF9	P41273	254 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	RABGGTB	P53611	331 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	TPM4	P67936	248 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	GRIK3	Q13003	919 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	NFIL3	Q16649	462 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	RASIP1	Q5U651	963 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	CENPP	Q6IPU0	288 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	ACAD11	Q709F0	780 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	DAAM2	Q86T65	1068 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	LRRC43	Q8N309	656 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	FIBCD1	Q8N539	461 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	PHC3	Q8NDX5	983 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	BEST2	Q8NFU1	509 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC39A13	Q96H72	371 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNX27	Q96L92	541 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	FRMD6	Q96NE9	622 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	ASB7	Q9H672	318 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPHS2	Q9NP85	383 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARL5C	A6NH57	179 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	BECN2	A8MW95	431 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	LACTBL1	A8MY62	500 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	STX10	O60499	249 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	WISP1	O95388	367 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	CAVIN2	O95810	425 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	POMC	P01189	267 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	TNNC2	P02585	160 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	ALDH2	P05091	517 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	GLB1	P16278	677 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	LAG3	P18627	525 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	TNNI1	P19237	187 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR1G1	P47890	313 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	GATM	P50440	423 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	SCNN1G	P51170	649 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	VAMP7	P51809	220 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	SESN3	P58005	492 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLCB3	Q01970	1234 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	PSMD6	Q15008	389 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPATA1	Q5VX52	437 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARMC3	Q5W041	872 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	TTI2	Q6NXR4	508 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ECHDC1-208	ENST00000436638	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		6.61	□□□□□ -1.35

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